MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3031882118 · doi:10.1200/jco.2020.38.15_suppl.3546

Demonstrating the value of liquid biopsy for lung cancer in a public health care system.

2020· article· en· W3031882118 sur OpenAlexaffabout
Rosalyn A. Juergens, Doreen A. Ezeife, Janessa Laskin, Jason Agulnik, Desirée Hao, Scott A. Laurie, Jennifer Law, Lisa W. Le, Lesli A. Kiedrowski, Frances A. Shepherd, Victor Cohen, Aria Shokoohi, R Vandermeer, Janice J.N. Li, Inna Hanson, Roxanne Fernandes, Alexandra Salvarrey, Richard B. Lanman, Natasha B. Leighl

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensNiagara Health SystemUniversity Health NetworkPrincess Margaret Cancer CentreOttawa HospitalBaker Hughes (Canada)University of CalgaryUniversity of OttawaJewish General HospitalMcMaster UniversityJuravinski Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineKRASROS1Lung cancerInternal medicineCohortOncologyLiquid biopsyAdenocarcinomaProspective cohort studyClinical endpointClinical trialCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

3546 Background: Given the challenges of molecular profiling in patients with advanced lung cancer, this prospective study examines clinical outcomes and utility of liquid biopsy in treatment naive stage IV lung adenocarcinoma patients (Cohort 1) and in the setting of resistance to targeted therapy (Cohort 2; not reported here). Methods: This study is being conducted at 6 Canadian centres (NCT03576937) using Guardant 360 (G360), a validated cell-free DNA next-generation sequencing assay that identifies variants in 74 cancer-associated genes, including fusions and copy number gain. Cohort 1 (N = 150) includes patients with treatment-naïve advanced non-squamous lung carcinoma, ≤10 pack-year smoking history, and measurable disease. Patients received standard of care tumour tissue (TT) molecular profiling ( EGFR, ALK +/- ROS1) and liquid biopsy (LB). The primary endpoint was response rate to first-line therapy (RECIST 1.1); secondary endpoints include incremental targetable alterations identified through G360 ( EGFR, ALK, BRAF, ERBB2, KRAS (G12C), NTRK, MET (amplification, exon 14 skipping), RET, ROS1), turn-around time (TAT) and successful molecular profiling rates. Results: To date, 84 eligible patients with clinical data have been accrued to Cohort 1. Median age is 64 (range 23-91), 64% are female, 85% never smokers, 96% have adenocarcinoma. Actionable targets have been identified in 55% of patients using G360 ( EGFR/ALK in 37%), 39% using standard TT profiling. Eight EGFR/ALK aberrations were identified in TT but not LB, while 6 were identified in LB but not TT. TT profiling for EGFR/ALK was unsuccessful in 8% of patients (insufficient tissue, failed biopsy). Fourteen patients (17%) had no ctDNA alterations detected by G360 (low disease burden vs. non-shedding). Of 75 patients receiving first-line treatment, 57% received targeted therapy, 28% chemotherapy combinations, 11% checkpoint inhibitors and 4% were observed. Treatment decisions were informed by G360 alone in 37% and by G360+TT results in 27% (by physician report). Among 46 evaluable patients, ORR was 54% (25/46). Using G360, ORR was 75% (15/20) in those with actionable alterations and 38.5% (10/26) in those without. Using TT, ORR was 67% (14/21) in those with actionable alterations and 44% (11/25) in those without. Mean TAT was 7.9 days (SD+/-1.7) for LB vs 19.9 days (SD+/- 9.8) for TT. Conclusions: Liquid biopsy using G360 identifies actionable targets beyond tissue profiling alone in newly diagnosed lung cancer patients, has faster TAT and yields similar outcomes with targeted and non-targeted therapy. Clinical trial information: NCT03576937 .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,343
Score d'incertitude au seuil0,683

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,086
Tête enseignante GPT0,445
Écart entre enseignants0,359 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Clinical OncologyMême sujetCancer Genomics and DiagnosticsTravaux en français237 207