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Enregistrement W3031981371 · doi:10.1111/jon.12725

Machine Learning and Multiparametric Brain MRI to Differentiate Hereditary Diffuse Leukodystrophy with Spheroids from Multiple Sclerosis

2020· article· en· W3031981371 sur OpenAlexafffund
Gabriel Mangeat, Russell Ouellette, Maxime Wabartha, Benjamin De Leener, Michael Plattén, Virginija Danylaité Karrenbauer, Marcel Warntjes, Nikola Stikov, Caterina Mainero, Julien Cohen‐Adad, Tobias Granberg

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuroimaging · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA regulation and disease
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Heart InstitutePolytechnique Montréal
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Foundation for Innovation
Mots-clésMedicineMultiple sclerosisMagnetic resonance imagingFalse discovery rateConfidence intervalMri scanNuclear medicineRadiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND PURPOSE: Hereditary diffuse leukoencephalopathy with spheroids (HDLS) and multiple sclerosis (MS) are demyelinating and neurodegenerative disorders that can be hard to distinguish clinically and radiologically. HDLS is a rare disorder compared to MS, which has led to occurrent misdiagnosis of HDLS as MS. That is problematic since their prognosis and treatment differ. Both disorders are investigated by MRI, which could help to identify patients with high probability of having HDLS, which could guide targeted genetic testing to confirm the HDLS diagnosis. METHODS: Here, we present a machine learning method based on quantitative MRI that can achieve a robust classification of HDLS versus MS. Four HDLS and 14 age-matched MS patients underwent a quantitative brain MRI protocol (synthetic MRI) at 3 Tesla (T) (scan time <7 minutes). We also performed a repeatability analysis of the predicting features to assess their generalizability by scanning a healthy control with five scan-rescans at 3T and 1.5T. RESULTS: Our predicting features were measured with an average confidence interval of 1.7% (P = .01), at 3T and 2.3% (P = .01) at 1.5T. The model gave a 100% correct classification of the cross-validation data when using 5-11 predicting features. When the maximum measurement noise was inserted in the model, the true positive rate of HDLS was 97.2%, while the true positive rate of MS was 99.6%. CONCLUSIONS: This study suggests that computer-assistance in combination with quantitative MRI may be helpful in aiding the challenging differential diagnosis of HDLS versus MS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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