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Enregistrement W3032311445 · doi:10.1371/journal.pone.0233727

Characterization of occult hepatitis B in high-risk populations in Kenya

2020· article· en· W3032311445 sur OpenAlexafffund
Kiptoon Beatrice Jepkemei, Missiani Ochwoto, Ken Swidinsky, Jacqueline Day, Henok Gebrebrhan, Lyle R. McKinnon, Anton Andonov, Julius Oyugi, Joshua Kimani, George Gachara, Elijah Songok, Carla Osiowy

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis B Virus Studies
Établissements canadiensUniversity of ManitobaPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésHBsAgMedicineHepatitis B virusHepatocellular carcinomaSerologyVirologyHepatitis BTransmission (telecommunications)JaundiceMen who have sex with menImmunologyInternal medicineAntibodyVirusHuman immunodeficiency virus (HIV)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Occult hepatitis B infection (OBI) is defined as the presence of hepatitis B virus (HBV) DNA in the liver or serum in the absence of detectable HBV surface antigen (HBsAg). OBI poses a risk for the development of cirrhosis and hepatocellular carcinoma. The prevalence of OBI in Kenya is unknown, thus a study was undertaken to determine the prevalence and molecular characterization of OBI in Kenyan populations at high risk of HBV infection. Sera from two Nairobi cohorts, 99 male sex workers, primarily having sex with men (MSM-SW), and 13 non-MSM men having HIV-positive partners, as well as 65 HBsAg-negative patients presenting with jaundice at Kenyan medical facilities, were tested for HBV serological markers, including HBV DNA by real-time PCR. Positive DNA samples were sequenced and MSM-SW patients were further tested for hepatitis C virus (HCV) infection. Of the 166 HBsAg-negative samples tested, 31 (18.7%; 95% confidence interval [CI] 13.5-25.3) were HBV DNA positive (i.e., occult), the majority (20/31; 64.5%) of which were HBV core protein antibody positive. HCV infection was not observed in the MSM-SW participants, although the prevalence of HBsAg positivity was 10.1% (10/99; 95% CI 5.6-17.6). HBV genotype A was predominant among study cases, including both HBsAg-positive and OBI participants, although the data suggests a non-African network transmission source among MSM-SW. The high prevalence of HBV infection among MSM-SW in Kenya suggests that screening programmes be instituted among high-risk cohorts to facilitate preventative measures, such as vaccination, and establish entry to treatment and linkage to care.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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