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Enregistrement W3032948775 · doi:10.1038/s41533-020-0181-3

Validating a case definition for adult asthma in primary care electronic medical records

2020· article· en· W3032948775 sur OpenAlexaffabout
Andrew Cave, Boglárka Soós, Christina Gillies, Neil Drummond, Anh Nguyet Pham, Tyler Williamson

Notice bibliographique

Revuenpj Primary Care Respiratory Medicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Disease Management Strategies
Établissements canadiensUniversity of CalgaryUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineAsthmaMedical recordFamily medicinePopulationPrimary careElectronic health recordMEDLINEElectronic medical recordHealth carePediatricsInternal medicineEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although asthma is one of the most common chronic conditions affecting Canadians, its epidemiologic characteristics and burden in primary care contexts are poorly understood. The aim of this study was to develop and validate a case definition to identify adults with asthma who consult family physicians and to estimate the prevalence of asthma in that setting in Canada. This validation study utilized a database of electronic medical records (EMRs) from the Southern Alberta Primary Care Research Network, a node of the Canadian Primary Care Sentinel Surveillance Network (SAPCReN-CPCSSN). The population included patients over age 17y of any gender and health status who had visited an SAPCReN-CPCSSN primary care provider during the period December 1, 2014-December 31, 2016. The validation of the case definition involved comparing a case-finding algorithm to caseness determined by an expert physician review of the records of 1000 patient in the CPCSSN database. The case definition, which included the ICD-9 code 493 and asthma-related text words, had 83.33% sensitivity (95% CI: 63.61-93.88%), 99.28% specificity (95% CI: 98.51-99.67%), a positive predictive value of 74.07% (95% CI: 55.03-87.14%), and a negative predictive value of 99.59% (95% CI: 98.93-99.86%). The prevalence of adult asthma in CPCSSN primary care practices in southern Alberta was 4.20% (95% CI: 4.09-4.31). The strong validation metrics suggest that this case definition is valid for both clinical and research purposes. The validated case definition may be used to improve patient care and improve understanding of the prevalence and burden of asthma in primary care in Canada.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,705
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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