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Enregistrement W3032974506 · doi:10.14745/ccdr.v46i05a05

Modified two-tiered testing algorithm for Lyme disease serology: the Canadian context

2020· review· en· W3032974506 sur OpenAlexaffvenueabout
Todd F. Hatchette, L. Robbin Lindsay

Notice bibliographique

RevueCanada Communicable Disease Report · 2020
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueVector-borne infectious diseases
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLyme diseaseSerologyContext (archaeology)MedicineBorrelia burgdorferiImmunoassayLYMEAlgorithmImmunologyAntibodyBiologyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Lyme disease (LD) is emerging in many parts of central and eastern Canada.Serological testing is most commonly used to support laboratory diagnosis of LD.Standard two-tiered testing (STTT) for LD involves detection of Borrelia burgdorferi antibodies using an enzyme immunoassay (EIA) followed by IgM and/or IgG immunoblots.However, improved sensitivity has been demonstrated using a modified two-tiered testing (MTTT) approach, in which a second EIA instead of the traditional immunoblot is used.This article summarises the evidence supporting the MTTT versus STTT for laboratory diagnosis of LD in Canada.Methods: Peer reviewed literature on the sensitivity and specificity of different EIAs were compared by Canadian experts in LD diagnostic for MTTT vs STTT in patients with clinical history of LD residing in LD endemic areas or in samples from the LD serum repository.Results: The MTTT approach consistently demonstrated improved sensitivity to detect early infections with B. burgdorferi and also maintained high specificity vs STTT.Conclusion: Diagnostic improvements in sensitivity of LD testing without significant loss of specificity have been consistently reported when MTTT is compared with STTT in studies conducted in highly LD endemic regions.Our working group agrees with the recommendation by the United States Centers for Disease Control that serological testing for LD using MTTT is an acceptable alternative to STTT.This recommendation is contingent on development and implementation of comprehensive validation studies on the performance of MTTT vs STTT within the Canadian context, including evaluation of the test performance in areas of low endemicity for LD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,015
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,606
Score d'incertitude au seuil0,783

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,015
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0050,004
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0040,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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