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Enregistrement W3033080442 · doi:10.3390/ijns6020046

Performance of a Three-Tier (IRT-DNA-IRT) Cystic Fibrosis Screening Algorithm in British Columbia

2020· article· en· W3033080442 sur OpenAlexaffabout
Graham Sinclair, Vanessa McMahon, Amy Schellenberg, Tanya N. Nelson, Mark Chilvers, Hilary Vallance

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Neonatal Screening · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAlgorithmCystic fibrosisMedicineComputer sciencePsychologyClinical psychologyArtificial intelligenceInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Newborn screening for Cystic Fibrosis has been implemented in most programs worldwide, but the approach used varies, including combinations of immunoreactive trypsinogen (IRT) and CFTR mutation analysis on one or more specimens. The British Columbia (BC) newborn screening program tests ~45,000 infants per year in BC and the Yukon Territory, covering almost 1.5 million km2 in western Canada. CF screening was initiated using an IRT-DNA-IRT approach with a second bloodspot card at 21 days of age for all CFTR mutation heterozygotes and any non-carriers in the top 0.1% for IRT. This second IRT was implemented to avoid sweat testing of infants without persistent hypertrypsinemia, reducing the burden of travel for families. Over nine years (2010–2018), 401,977 infants were screened and CF was confirmed in 76, and a further 28 were deemed CF screen positive inconclusive diagnosis (CFSPID). Day 21 IRT was normal in 880 CFTR mutation carriers who were quoted a very low CF risk and offered optional sweat testing. Only 13% of families opted for sweat testing and a total of 1036 sweat tests were avoided. There were six false negative CF cases (and three CFSPID) due to a low initial IRT or no CFTR mutations. Although one CFSPID case had a normal repeat IRT result, the addition of the day 21 IRT did not contribute to any CF false negatives.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,810
Score d'incertitude au seuil0,791

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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