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Enregistrement W3033125864 · doi:10.1371/journal.pgen.1008718

Novel loci for childhood body mass index and shared heritability with adult cardiometabolic traits

2020· review· en· W3033125864 sur OpenAlexafffund
Suzanne Vogelezang, Jonathan P. Bradfield, Tarunveer S. Ahluwalia, John A. Curtin, Timo A. Lakka, Niels Grarup, Markus Scholz, Peter J. van der Most, Claire Monnereau, Evie Stergiakouli, Anni Heiskala, Momoko Horikoshi, Iryna O. Fedko, Natàlia Vilor‐Tejedor, Diana L. Cousminer, Marie Standl, Carol A. Wang, Jorma Viikari, Frank Geller, Carmen Íñiguez, Niina Pitkänen, Alessandra Chesi, Jonas Bačelis, Loïc Yengo, Maties Torrent, Ιωάννα Ντάλλα, Øyvind Helgeland, Saskia Selzam, Judith M. Vonk, Mohammed H. Zafarmand, Barbara Heude, I. Sadaf Farooqi, Akram Alyass, Robin N. Beaumont, Peter Rzehak, José Ramón Bilbao, Theresia M. Schnurr, Inês Barroso, Klaus Bønnelykke, Lawrence J. Beilin, Lisbeth Carstensen, Marie‐Aline Charles, Bo Chawes, Karine Clément, Ricardo Closa‐Monasterolo, Adnan Čustović, Johan G. Eriksson, Joaquín Escribano, Maria M. Groen‐Blokhuis, Veit Grote, Dariusz Gruszfeld, Håkon Håkonarson, Torben Hansen, Andrew T. Hattersley, Mette Hollensted, Jouke‐Jan Hottenga, Elina Hyppönen, Stefan Johansson, Raimo Joro, Mika Kähönen, Ville Karhunen, Wieland Kieß, Bridget Knight, Berthold Koletzko, Andreas Kühnapfel, Kathrin Landgraf, Jean‐Paul Langhendries, Terho Lehtimäki, Jaakko T. Leinonen, Aihuali Li, Virpi Lindi, Estelle Lowry, Mariona Bustamante, Carolina Medina‐Gómez, Mads Melbye, Kim F. Michaelsen, Camilla S. Morgen, Trevor A. Mori, Tenna Ruest Haarmark Nielsen, Harri Niinikoski, Albertine J. Oldehinkel, Katja Pahkala, Kalliope Panoutsopoulou, Oluf Pedersen, Craig E. Pennell, Christopher Power, Sijmen A. Reijneveld, Fernando Rivadeneira, Angela Simpson, Peter D. Sly, Jakob Stokholm, Koon Teo, Elisabeth Thiering, Nicholas J. Timpson, André G. Uitterlinden, Barbera D. C. van Schaik, Marc Vaudel, Elvira Verduci, Rebecca Vinding, Mandy Vogel, Eleftheria Zeggini, Sylvain Sebért, Mads Vendelbo Lind, Christopher D. Brown, Loreto Santa‐Marina, Eva Reischl, Christine Frithioff‐Bøjsøe, David Meyre, Eleanor Wheeler, Ken K. Ong, Ellen A. Nøhr, Tanja G. M. Vrijkotte, Gerard H. Koppelman, Robert Plomin, Pål R. Njølstad, George D. Dedoussis, Philippe Froguel, Thorkild I. A. Sørensen, Bo Jacobsson, Rachel M. Freathy, Babette S. Zemel, Olli T. Raitakari, Martine Vrijheid, Bjarke Feenstra, Leo‐Pekka Lyytikäinen, Harold Snieder, Holger Kirsten, Patrick G. Holt, Joachim Heinrich, Elisabeth Widén, Jordi Sunyer, Dorret I. Boomsma, Marjo‐Riitta Järvelin, Antje Körner, George Davey Smith, Jens‐Christian Holm, Mustafa Atalay, Clare Murray, Hans Bisgaard, Mark I. McCarthy, Vincent W. V. Jaddoe, Struan F.A. Grant, Janine F. Felix

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2020
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensMcMaster UniversityImpact
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNIHR Cambridge Biomedical Research CentreFondation BotnarMedical Research Council CanadaNovo Nordisk FondenIsrael Science FoundationGreat Ormond Street Hospital for ChildrenLundbeckfondenNational Institute for Health and Care ResearchGeneralitat de CatalunyaNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesZonMwMedical Research CouncilKoninklijke Nederlandse Akademie van WetenschappenUniversity of BristolAmerican Diabetes AssociationWellcome TrustSteno Diabetes Center CopenhagenDanish Diabetes AcademySuomen KulttuurirahastoNational Institutes of HealthNIHR Biomedical Research Centre, Royal Marsden NHS Foundation Trust/Institute of Cancer Research
Mots-clésBody mass indexHeritabilityChildhood obesityBiologyTwin studyMenarcheGenome-wide association studyObesityGeneticsDemographyOverweightEndocrinologyGenotypeSingle-nucleotide polymorphismGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The genetic background of childhood body mass index (BMI), and the extent to which the well-known associations of childhood BMI with adult diseases are explained by shared genetic factors, are largely unknown. We performed a genome-wide association study meta-analysis of BMI in 61,111 children aged between 2 and 10 years. Twenty-five independent loci reached genome-wide significance in the combined discovery and replication analyses. Two of these, located near NEDD4L and SLC45A3, have not previously been reported in relation to either childhood or adult BMI. Positive genetic correlations of childhood BMI with birth weight and adult BMI, waist-to-hip ratio, diastolic blood pressure and type 2 diabetes were detected (Rg ranging from 0.11 to 0.76, P-values <0.002). A negative genetic correlation of childhood BMI with age at menarche was observed. Our results suggest that the biological processes underlying childhood BMI largely, but not completely, overlap with those underlying adult BMI. The well-known observational associations of BMI in childhood with cardio-metabolic diseases in adulthood may reflect partial genetic overlap, but in light of previous evidence, it is also likely that they are explained through phenotypic continuity of BMI from childhood into adulthood.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations233
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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