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Enregistrement W3033235341 · doi:10.1101/2020.06.04.20121061

A genome-wide association study of total child psychiatric problems scores

2020· preprint· en· W3033235341 sur OpenAlexaff
Alexander Neumann, Ilja M. Nolte, Irene Pappa, Tarunveer S. Ahluwalia, Erik Pettersson, Alina Rodriguez, Andrew Whitehouse, Beben Benyamin, Anke R. Hammerschlag, Quinta Helmer, Ville Karhunen, Eva Krapohl, Yi Lu, Peter J. van der Most, Teemu Palviainen, Beaté St Pourcain, Ilkka Seppälä, Anna Suarez, Natàlia Vilor‐Tejedor, Carla M. T. Tiesler, Carol A. Wang, Amanda G. Wills, Ang Zhou, Silvia Alemany, Hans Bisgaard, Klaus Bønnelykke, Gareth E. Davies, Christian Hakulinen, Anjali K. Henders, Elina Hyppönen, Jakob Stokholm, Meike Bartels, Jouke‐Jan Hottenga, Joachim Heinrich, John K. Hewitt, Liisa Keltikangas‐Järvinen, Tellervo Korhonen, Jaakko Kaprio, Jari Lahti, Marius Lahti‐Pulkkinen, Terho Lehtimäki, Christel M. Middeldorp, Craig E. Pennell, Chris Power, Albertine J. Oldehinkel, Robert Plomin, Katri Räikkönen, Olli T. Raitakari, Kaili Rimfeld, Lærke Sass, Harold Snieder, Marie Standl, Jordi Sunyer, Gail Williams, Marian J. Bakermans‐Kranenburg, Dorret I. Boomsma, Marinus H. van IJzendoorn, Catharina A. Hartman, Henning Tiemeier

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensJewish General Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesSigne ja Ane Gyllenbergin SäätiöMedical Research CouncilPaavo Nurmen SäätiöSydäntutkimussäätiöEmil Aaltosen SäätiöJuho Vainion SäätiöGreat Ormond Street Hospital for ChildrenSuomen KulttuurirahastoZonMwTampereen TuberkuloosisäätiöKelaAcademy of FinlandEconomic and Social Research CouncilEuropean CommissionWellcome TrustUniversity College LondonJuvenile Diabetes Research Foundation InternationalNational Institute for Health and Care ResearchDiabetesliittoNational Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNIHR Biomedical Research Centre, Royal Marsden NHS Foundation Trust/Institute of Cancer ResearchFoundation for Cardiovascular ResearchNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek
Mots-clésPsychiatric geneticsPsychiatryGenome-wide association studyBipolar disorderPsychopathologySchizophrenia (object-oriented programming)Twin studyAutismAnxietyPopulationAttention deficit hyperactivity disorderNeuroticismGenetic associationMedicineEpidemiology of child psychiatric disordersSingle-nucleotide polymorphismClinical psychologyHeritabilityPsychologyGeneticsBiologyPersonalityGenotypeGeneLithium (medication)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Substantial genetic correlations have been reported across psychiatric disorders and numerous cross-disorder genetic variants have been detected. To identify the genetic variants underlying general psychopathology in childhood, we performed a genome-wide association study using a total psychiatric problem score. We analyzed 6,844,199 common SNPs in 38,418 school-aged children from 20 population-based cohorts participating in the EArly Genetics and Lifecourse Epidemiology (EAGLE) consortium. The SNP heritability of total psychiatric problems was 5.4% (SE=0.01) and two loci reached genome-wide significance: rs10767094 and rs202005905. We also observed an association of SBF2 , a gene associated with neuroticism in previous GWAS, with total psychiatric problems. The genetic effects underlying the total psychiatric problem score were shared with known genetic variants for common psychiatric disorders only (attention-deficit/hyperactivity disorder, anxiety, depression, insomnia) (r G > 0.49), but not with autism or the less common adult disorders (schizophrenia, bipolar disorder, or eating disorders) (r G < 0.01). Importantly, the total psychiatric problem score also showed at least a moderate genetic correlation of with intelligence, educational attainment, wellbeing, smoking, and body fat (r G > 0.29).The results suggest that many common genetic variants are associated with childhood psychiatric symptoms and related phenotypes in general instead of with specific symptoms. Further research is needed to establish causality and pleiotropic mechanisms between psychiatric disorders and related traits.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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