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Enregistrement W3033371772 · doi:10.1101/2020.06.04.133652

Secretion, maturation and activity of a quorum-sensing peptide (GSP) inducing bacteriocins transcription in <i>Streptococcus gallolyticus</i>

2020· preprint· en· W3033371772 sur OpenAlexfundno aff
Anthony Harrington, Alexis Proutière, Shaynoor Dramsi, Yftah Tal‐Gan

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueStreptococcal Infections and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDivision of ChemistryUniversity of TorontoUniversity of Nevada, RenoNational Science Foundation
Mots-clésBacteriocinBiologyQuorum sensingMicrobiologySecretionGenePeptideTranscription (linguistics)PathogenGeneticsAntimicrobialBiochemistryVirulence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus ( Sgg ) is an emerging opportunistic pathogen responsible for septicemia and endocarditis in the elderly. Invasive infections by Sgg are strongly linked to the occurrence of colorectal cancer (CRC). It was previously shown that increased secondary bile salts in CRC-conditions enhances the bactericidal activity of gallocin, a bacteriocin produced by Sgg , enabling it to colonize the mouse colon by outcompeting resident enterococci. In a separate study, we have shown that Sgg produces and secretes a 21-mer peptide that activates bacteriocin production. This peptide was named CSP because of its sequence similarity with competence stimulating peptides found in other streptococci. Here we demonstrate that CSP is a bona fide quorum-sensing peptide involved in activation of gallocin gene transcription. We therefore refer to CSP as GSP (gallocin stimulating peptide). GSP displays some unique features since its N -terminal amino-acid lies three residues after the double glycine leader sequence. Herein, we set out to investigate the processing and export pathway that leads to mature GSP. We also conducted the first comprehensive structure-activity relationship (SAR) of Sgg GSP to identify its key structural features. Significance Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus ( Sgg ) is an opportunistic pathogen associated with colorectal cancer (CRC) and endocarditis. Sgg utilizes quorum-sensing (QS) to regulate the production of a bacteriocin (gallocin) and gain selective advantage in colonizing the colon. In this manuscript, we report 1) the first structure-activty relationship study of the Sgg QS pheromone that regulates gallocin production; 2) evidence that the active QS pheromone is processed to its mature form by a unique ABC transporter and not processed by an extracellular protease; and 3) supporting evidence of interspecies interactions between streptococci pheromones. Our results revealed the minimal pheromone scaffold needed for gallocin activation and uncovered unique interactions between two streptococci species QS signals that warrant further studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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