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Enregistrement W3033518880 · doi:10.1101/2020.06.05.20123406

Circulating fibrocytes can identify people with a poor prognosis in idiopathic pulmonary fibrosis

2020· preprint· en· W3033518880 sur OpenAlexaff
Iain Stewart, Henry Nanji, Grazziela P. Figueredo, William A. Fahy, Toby M. Maher, Antje Ask, Shyam Maharaj, Kjetil Ask, Martin Kolb, Gísli Jenkins

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInterstitial Lung Diseases and Idiopathic Pulmonary Fibrosis
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésFibrocyteMedicineIdiopathic pulmonary fibrosisHazard ratioProspective cohort studyPulmonary fibrosisInternal medicinePulmonary function testingCohortProportional hazards modelFibrosisCohort studyBiomarkerInterstitial lung diseaseLungGastroenterologyOncologyPathologyConfidence intervalBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objective Circulating fibrocytes are elevated in idiopathic pulmonary fibrosis, but the relationship between fibrocyte level with lung function decline and outcomes is lacking replication in prospective clinical study. We aim to validate the utility of circulating fibrocyte levels as a prognostic biomarker in idiopathic pulmonary fibrosis. Methods We tested associations between circulating fibrocyte levels, mortality, disease progression and longitudinal lung function in a well-defined prospective observational study of pulmonary fibrosis (PROFILE; NCT01134822 ). A subset of recruited participants had blood samples processed for fibrocyte measurement, with flow cytometry based on CD45 and collagen-I gating. Associations were tested using univariable and multivariable generalised linear models. Mortality data were subsequently combined with an independent cohort in a mixed-effect multilevel analysis. Results In 102 participants with idiopathic pulmonary fibrosis, an empirically defined cutpoint of 2.22% was associated with a greater risk of overall mortality in adjusted analysis (Hazard Ratio 2.24 95% CI 1.06-4.72). A 2.5 fold greater risk of mortality was supported in a pooled analysis with a historic cohort for a larger sample of 162 participants of idiopathic pulmonary fibrosis, specifically (Hazard Ratio 2.49 95% CI 2.41-2.56). A previously defined mortality risk threshold of 5% circulating fibrocytes was not reproducible in this cohort, circulating fibrocytes were not significantly elevated above non-specific interstitial pneumonia or healthy controls.. We found no association of fibrocytes with lung function or disease progression. Conclusions In a prospective clinical cohort of idiopathic pulmonary fibrosis, circulating fibrocytes of 2.22% or above are associated with greater mortality, but do not associate with disease related decline in lung function. What is the key question? Can circulating fibrocytes provide reproducible prognostic biomarker value in fibrotic lung disease? What is the bottom line? Greater proportions of fibrocytes isolated from circulating leukocyte populations are associated with an increase risk of mortality in idiopathic pulmonary fibrosis, but no association was observed with disease related decline in lung function. Why read on? We present associations and limitations of circulating fibrocytes in the largest sample of individuals with pulmonary fibrosis, recruited into a prospective observational study, and replicate prognositic insights from a historic cohort.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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