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Enregistrement W3033672396 · doi:10.18383/j.tom.2020.00004

Multisite Technical and Clinical Performance Evaluation of Quantitative Imaging Biomarkers from 3D FDG PET Segmentations of Head and Neck Cancer Images

2020· article· en· W3033672396 sur OpenAlexaff
John M. Buatti, Christian Bauer, Ethan Ulrich, Payam Ahmadvand, Mikalai M. Budzevich, Robert J. Gillies, Dmitry B. Goldgof, Milan Grkovski, Ghassan Hamarneh, Paul E. Kinahan, John P. Muzi, Mark Muzi, Charles M. Laymon, James M. Mountz, Sadek A. Nehmeh, Matthew J. Oborski, Binsheng Zhao, John J. Sunderland, Reinhard Beichel

Notice bibliographique

RevueTomography · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Cancer InstituteHolden Comprehensive Cancer Center, University of IowaNational Institutes of Health
Mots-clésSegmentationRobustness (evolution)Positron emission tomographyArtificial intelligenceComputer scienceMedicineMedical physicsPattern recognition (psychology)Radiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Quantitative imaging biomarkers (QIBs) provide medical image-derived intensity, texture, shape, and size features that may help characterize cancerous tumors and predict clinical outcomes. Successful clinical translation of QIBs depends on the robustness of their measurements. Biomarkers derived from positron emission tomography images are prone to measurement errors owing to differences in image processing factors such as the tumor segmentation method used to define volumes of interest over which to calculate QIBs. We illustrate a new Bayesian statistical approach to characterize the robustness of QIBs to different processing factors. Study data consist of 22 QIBs measured on 47 head and neck tumors in 10 positron emission tomography/computed tomography scans segmented manually and with semiautomated methods used by 7 institutional members of the NCI Quantitative Imaging Network. QIB performance is estimated and compared across institutions with respect to measurement errors and power to recover statistical associations with clinical outcomes. Analysis findings summarize the performance impact of different segmentation methods used by Quantitative Imaging Network members. Robustness of some advanced biomarkers was found to be similar to conventional markers, such as maximum standardized uptake value. Such similarities support current pursuits to better characterize disease and predict outcomes by developing QIBs that use more imaging information and are robust to different processing factors. Nevertheless, to ensure reproducibility of QIB measurements and measures of association with clinical outcomes, errors owing to segmentation methods need to be reduced.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,026
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,071
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,137

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0260,071
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,395
Écart entre enseignants0,359 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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