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Enregistrement W3033695919 · doi:10.1139/cjm-2019-0551

Variety features differentiate microbiota in the grape leaves

2020· article· en· W3033695919 sur OpenAlexvenueno aff
Shiwei Zhang, Yuan Wang, Xi Chen, Bingjian Cui, Zhihui Bai, Guoqiang Zhuang

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFermentation and Sensory Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesChinese Academy of SciencesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyBotanyMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The dependence of plant health and crop quality on the epiphytic microbial community has been extensively addressed, but little is known about plant-associated microbial communities under natural conditions. In this study, the bacterial and fungal communities on grape leaves were analyzed by 16S rRNA gene and internal transcribed spacer high-throughput sequencing, respectively. The results showed differences in the composition of the microbial communities on leaf samples of nine wine grape varieties. The most abundant bacterial genus was Pseudomonas, and the top three varieties with Pseudomonas were Zinfandel (22.6%), Syrah (21.6%), and Merlot (13.5%). The most abundant fungal genus was Alternaria, and the cultivar with the lowest abundance of Alternaria was Zinfandel (33.6%), indicating that these communities had different habitat preferences. The linear discriminant analysis effect size of all species showed that the bacteria Enterococcus, Massilia, and Kocuria were significantly enriched on the leaves of Merlot, Syrah, Cabernet Sauvignon, respectively; Pseudomonadales and Pantoea on Zinfandel; and Bacillus, Turicibacter, and Romboutsia on Pinot Noir. Similarly, the fungi Cladosporium, Phoma, and Sporormiella were significantly enriched on Zinfandel, Lon, and Gem, respectively. Both Bray–Curtis and unweighted UniFrac revealed that bacteria and fungi have a significant impact (P < 0.01), and the results further proved that variety is the most important factor affecting the microbial community. The findings indicate that some beneficial or harmful microorganisms existing on the wine grape leaves might affect the health of the grape plants and the wine-making process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,960
Score d'incertitude au seuil0,951

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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