MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3033804865 · doi:10.12688/wellcomeopenres.15806.1

Ethical challenges in pathogen sequencing: a systematic scoping review

2020· preprint· en· W3033804865 sur OpenAlex
Stephanie Johnson, Michael Parker

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueWellcome Open Research · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEthics in Clinical Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesWellcome Trust
Mots-clésContext (archaeology)Public healthEthical issuesPolitical scienceBiologyEngineering ethicsMedicineEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<ns4:p> <ns4:bold>Background</ns4:bold> : Going forward, the routine implementation of genomic surveillance activities and outbreak investigation is to be expected. We sought to systematically identify the emerging ethical challenges; and to systematically assess the gaps in ethical frameworks or thinking and identify where further work is needed to solve practical challenges. </ns4:p> <ns4:p> <ns4:bold>Methods</ns4:bold> : We systematically searched indexed academic literature from PubMed, Google Scholar, and Web of Science from 2000 to April 2019 for peer-reviewed articles that substantively engaged in discussion of ethical issues in the use of pathogen genome sequencing technologies for diagnostic, surveillance and outbreak investigation. </ns4:p> <ns4:p> <ns4:bold>Results</ns4:bold> : 28 articles were identified; nine United States, five United Kingdom, five The Netherlands, three Canada, two Switzerland, one Australia, two South Africa, and one Italy. Eight articles were specifically about the use of sequencing in HIV. Eleven were not specific to a particular disease. Results were organized into four themes: tensions between public and private interests; difficulties with translation from research to clinical and public health practice; the importance of community trust and support; equity and global partnerships; and the importance of context. </ns4:p> <ns4:p> <ns4:bold>Conclusion</ns4:bold> : While pathogen sequencing has the potential to be transformative for public health, there are a number of key ethical issues that must be addressed, particularly around the conditions of use for pathogen sequence data. Ethical standards should be informed by public values, and further empirical work investigating stakeholders’ views are required. Development in the field should also be under-pinned by a strong commitment to values of justice, in particular global health equity. </ns4:p>

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,144
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,171
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict), Science ouverte, Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesMétarecherche, Science ouverte, Intégrité de la recherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,519
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1440,171
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0060,022
Intégrité de la recherche0,0030,051
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,943
Tête enseignante GPT0,700
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle