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Enregistrement W3033807527 · doi:10.1080/09670262.2020.1744039

Iron uptake proteins in algae and the role of Iron Starvation-Induced Proteins (ISIPs)

2020· article· en· W3033807527 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Phycology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal ecosystems
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyBiochemistryPermeaseDMT1Iron deficiencyFerroportinFerritinAlgaeRed algaeTransferrin receptorTransporterTransferrinMetabolismBotanyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Iron is one of the most abundant elements on Earth, and it is essential for life. Despite the abundance of iron, its chemistry leads to very limited bioavailability, which has resulted in the evolution of a wide range of proteins involved in uptake and scavenging. However, because high intracellular concentrations of iron are toxic, iron homeostasis is essential for every organism. Approximately 30–40% of the ocean's surface is characterized by very low chlorophyll concentrations and high concentrations of nitrate and phosphate. These High Nutrient-Low Chlorophyll (HNLC) regions are also characterized by low concentrations of iron, and studies on low-iron adapted diatom strains revealed the presence of iron starvation-induced proteins (ISIP), a group of unrelated novel proteins that are strongly up-regulated under iron limitation. First functional characterizations show that some of these ISIP proteins are involved in iron uptake. Here, we compare iron-uptake/storage proteins from 15 different algal species demonstrating that some well-characterized uptake proteins such as Natural Resistance Associated Macrophage Proteins (NRAMP) or the iron transporter1 (FTR1)-like permease show high similarities throughout the 15 algal species, while others such as Zinc-Regulated Transporter (ZRT)- and Iron-Regulated Transporter (IRT)-like proteins (ZIP) have a higher diversity amongst the algae analysed here. The focus of this review is ISIP proteins, which are distinct from ZIP, NRAMP and FTR1 permeases. ISIP2 proteins are transferrin-like proteins involved in Fe3+ uptake and ISIP1 is responsible for endocytosis of siderophore-bound iron. Additionally, in-silico analysis, combined with our localization study in a marine diatom, suggests that ISIP3 acts as an iron storage protein. Overall, our analysis concludes that marine algae combine iron uptake strategies widespread in other organisms, with algal-specific ISIPs as additional proteins for the utilization of diverse iron pools, thereby securing their success in iron-poor regions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,695
Score d'incertitude au seuil0,552

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,184
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle