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Enregistrement W3033828382 · doi:10.1186/s13756-020-00752-3

Prevalence of Candida auris in Canadian acute care hospitals among at-risk patients, 2018

2020· article· en· W3033828382 sur OpenAlexafffundabout
Hector Felipe Garcia-Jeldes, Robyn Mitchell, Allison McGeer, Wallis Rudnick, Kanchana Amaratunga, Snigdha Vallabhaneni, Shawn R. Lockhart, Ghada N. Al‐Rawahi, Elizabeth Brodkin, Marthe Charles, Jeannette Comeau, Ian Davis, Johan Delport, Tanis C. Dingle, Philippe J. Dufresne, Chelsey Ellis, Joanne Embreé, Charles Frenette, George R. Golding, Linda Hoang, Susy Hota, Kevin Katz, Pamela Kibsey, Julianne V. Kus, Joanne M. Langley, Bonita E. Lee, Marie-Astrid Lefebvre, Yves Longtin, Kathy Malejczyk, Shazia Masud, Dominik Mertz, Michael R. Mulvey, Susan M. Poutanen, Dale Purych, Rajni Rantelidis, David Richardson, Ilan S. Schwartz, Stephanie Smith, Maxime-Antoine Tremblay, Titus Wong, Deborah Yamamura, Amrita Bharat

Notice bibliographique

RevueAntimicrobial Resistance and Infection Control · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensMount Sinai HospitalPublic Health Agency of CanadaUniversité Laval
Organismes subventionnairesCenters for Disease Control and PreventionFraser Health AuthorityBritish Columbia Centre for Disease ControlUniversity of AlbertaIWK Health CentreJewish General HospitalPublic Health AgencyMcGill UniversityMcGill University Health CentrePublic Health Agency of CanadaHamilton Health SciencesBC Children's HospitalMcMaster University
Mots-clésCandida aurisMedicineMedical microbiologyIndian subcontinentHealth carePrevalenceInternal medicineEmergency medicineIntensive care medicineEpidemiologyAntifungalDermatologyVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To identify the prevalence of C. auris in Canadian patients who are potentially at risk for colonization, we screened 488 patients who were either hospitalized abroad, had a carbapenemase-producing organism (CPO), or were in units with high antifungal use. Two patients were colonized with C. auris; both had received healthcare in India and had a CPO. Among 35 patients who had recently received healthcare in the Indian subcontinent and were CPO colonized or infected, the prevalence of C. auris was 5.7%.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,104

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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