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Enregistrement W3034086154 · doi:10.3748/wjg.v26.i21.2768

Gut microbiome in primary sclerosing cholangitis: A review

2020· review· en· W3034086154 sur OpenAlexaff
Rebecca B. Little, Eytan Wine, Binita M. Kamath, Anne M. Griffiths, Amanda Ricciuto

Notice bibliographique

RevueWorld Journal of Gastroenterology · 2020
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLiver Diseases and Immunity
Établissements canadiensSickKids FoundationUniversity of AlbertaHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPrimary sclerosing cholangitisMicrobiomeDysbiosisGut floraBiologyInflammatory bowel diseaseImmune systemImmunologyPathogenesisHuman Microbiome ProjectLiver diseaseDiseaseHuman microbiomeMedicineBioinformaticsPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Primary sclerosing cholangitis (PSC) is a chronic cholestatic liver disease characterized by biliary inflammation and stricturing.Exploration of the pathogenesis of PSC in light of its association with inflammatory bowel disease (IBD) and the "gut-liver" axis is an emerging area of interest.A growing number of studies have begun to elucidate the role of the gut microbiota, its metabolites and its influence on host immune responses in the development of PSC and PSC-IBD.Studies of the fecal microbiota have highlighted enriched levels of certain species, including Veillonella, Streptococcus and Enterococcus, among others.A heightened immune response to enteric dysbiosis and bacterial translocation have also been implicated.For example, Klebsiella pneumoniae strains derived from gnotobiotic mice transplanted with PSC-IBD microbiota were found to induce pore formation in human intestinal epithelial cells and enhanced Th17 responses.Gut microbes have additionally been hypothesized to be implicated in PSC pathogenesis through their role in the synthesis of various metabolites, including bile acids (BAs), which function as signaling molecules with important gut and hepatic effects.An expanded knowledge of the gut microbiome as it relates to PSC offers critical insight into the development of microbe-altering therapeutic interventions, such as antibiotics, nutritional interventions and fecal microbial transplantation.Some of these have already shown some preliminary evidence of benefit.Despite exciting progress in the field, much work remains to be done; areas that are particularly lacking include functional characterization of the microbiome and examination of pediatric populations.In this review, we summarize studies that have investigated the microbiome in PSC and PSC-IBD as well as putative mechanisms, including the potential role of metabolites, such as BAs.We then briefly review the evidence for interventions with microbe-altering properties for treating PSC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations123
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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