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Enregistrement W3034154131 · doi:10.1101/2020.06.04.133645

Quantitative longitudinal predictions of Alzheimer’s disease by multi-modal predictive learning

2020· preprint· en· W3034154131 sur OpenAlexfundno aff
Mithilesh Prakash, M.E. Abdelaziz, Li Zhang, Bryan A. Strange, Jussi Tohka

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthGenentechIXICOH. Lundbeck A/SKuopion Yliopistollinen SairaalaServierTekniikan EdistämissäätiöEisaiNorthern California Institute for Research and EducationPfizerBiogenBioClinicaF. Hoffmann-La RocheUniversity of Southern CaliforniaEli Lilly and CompanyU.S. Department of DefenseMeso Scale DiagnosticsAcademy of FinlandAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNovartis Pharmaceuticals CorporationBristol-Myers SquibbAlzheimer's AssociationFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésModalDemographicsPredictive modellingCorrelationMultivariate statisticsNeuroimagingAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeArtificial intelligenceDiseaseDementiaMachine learningMedicineComputer sciencePsychologyInternal medicineMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Quantitatively predicting the progression of Alzheimer’s disease (AD) in an individual on a continuous scale, such as AD assessment scale-cognitive (ADAS-cog) scores, is informative for a personalized approach as opposed to qualitatively classifying the individual into a broad disease category. We hypothesize that multi-modal data and predictive learning models can be employed for longitudinally predicting ADAS-cog scores. Methods Multivariate regression techniques were employed to model baseline multi-modal data (demographics, neuroimaging, and cerebrospinal fluid based markers, and genetic factors) and future ADAS-cog scores. Prediction models were subjected to repeated cross-validation and the resulting mean absolute error and cross-validated correlation of the model assessed. Results Prediction models on multi-modal data outperformed single modal data up to 36 months. Incorporating baseline ADAS-cog scores to prediction models marginally improved predictive performance. Conclusions Future ADAS-cog scores were successfully estimated via predictive learning aiding clinicians in identifying those at greater risk of decline and apply interventions at an earlier disease stage and inform likely future disease progression in individuals enrolled in AD clinical trials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,034

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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