MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3034223907 · doi:10.1101/mcs.a005298

Clinical IRAK4 deficiency caused by homozygosity for the novel <i>IRAK4</i> (c.1049delG, p.Gly350Glufs*15) variant

2020· article· en· W3034223907 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMolecular Case Studies · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesGenome British Columbia
Mots-clésInnate immune systemBiologyImmune systemImmunologyPattern recognition receptorStreptococcus pneumoniaePathogen-associated molecular patternSignal transductionToll-like receptorMicrobiologyCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The innate immune system allows for rapid recognition of pathogens. Toll-like receptor (TLR) signaling is a key aspect of the innate immune response, and interleukin-1 receptor-associated kinase 4 (IRAK4) plays a vital role in the TLR signaling cascade. Each TLR recognizes a distinct set of pathogen-associated molecular patterns (PAMPs) that encompass conserved microbial components such as lipopolysaccharides and flagellin. Upon binding of PAMPs and TLR activation, TLR intracellular domains initiate the oligomerization of the myeloid differentiation primary response 88 (MyD88), IRAK1, IRAK2, and IRAK4 signaling platform known as the Myddosome complex while also triggering the Toll/IL-1R domain-containing adaptor-inducing IFN-β (TRIF)-dependent pathway. The Myddosome complex initiates signal transduction pathways enabling the activation of NF-κB and mitogen-activated protein kinase (MAPK) transcription factors and the subsequent production of inflammatory cytokines. Human IRAK4 deficiency is an autosomal recessive inborn error of immunity that classically presents with blunted or delayed inflammatory response to infection and susceptibility to a narrow spectrum of pyogenic bacteria, particularly Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus aureus, and Pseudomonas aeruginosa. We describe a case of IRAK4 deficiency in an 11-mo-old boy with concurrent S. pneumoniae bacteremia and S. aureus cervical lymphadenitis with a blunted inflammatory response to invasive infection. Although initial clinical immune profiling was unremarkable, a high degree of suspicion for an innate immune defect prompted genetic sequencing. Genetic testing revealed a novel variant in the IRAK4 gene (c.1049delG, p.(Gly350Glufs*15)) predicted to be likely pathogenic. Functional testing showed a loss of IRAK4 protein expression and abolished TLR signaling, confirming the pathogenicity of this novel IRAK4 variant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,480
Score d'incertitude au seuil0,755

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle