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Enregistrement W3034235704 · doi:10.1636/0161-8202-48.2.103

Towards establishment of a centralized spider traits database

2020· article· en· W3034235704 sur OpenAlexaff
Elizabeth Lowe, Jonas O. Wolff, Alfonso Aceves‐Aparicio, Klaus Birkhofer, Vasco Veiga Branco, Pedro Cardoso, Filipe Chichorro, Caroline Sayuri Fukushima, Thiago Gonçalves‐Souza, Charles R. Haddad, Marco Isaia, Henrik Krehenwinkel, Tracy Audisio, Nuria Macías‐Hernández, Jagoba Malumbres‐Olarte, Stefano Mammola, Donald James McLean, Radek Michalko, Wolfgang Nentwig, Stano Pekár, Julien Pétillon, Kaïna Privet, Catherine Scott, George R. Uhl, Fernando Urbano-Tenorio, Boon Hui Wong, Marie E. Herberstein

Notice bibliographique

RevueJournal of Arachnology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSpider Taxonomy and Behavior Studies
Établissements canadiensAcadia University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCollationSpiderDatabaseTraitBiologyPopulationEcologyData scienceComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A main goal of ecological and evolutionary biology is understanding and predicting interactions between populations and both abiotic and biotic environments, the spatial and temporal variation of these interactions, and the effects on population dynamics and performance. Trait-based approaches can help to model these interactions and generate a comprehensive understanding of ecosystem functioning. A central tool is the collation of databases that include species trait information. Such centralized databases have been set up for a number of organismal groups but is lacking for one of the most important groups of predators in terrestrial ecosystems – spiders. Here we promote the collation of an open spider traits database, integrated into the global Open Traits Network. We explore the current collation of spider data and cover the logistics of setting up a global database, including which traits to include, the source of data, how to input data, database governance, geographic cover, accessibility, quality control and how to make the database sustainable long-term. Finally, we explore the scope of research questions that could be investigated using a global spider traits database.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,027
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,041
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,142

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0270,041
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0090,009
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0100,012
Science ouverte0,0060,010
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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