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Enregistrement W3034309595 · doi:10.1038/s41598-020-66662-x

Malodorous biogenic amines in Escherichia coli-caused urinary tract infections in women—a metabolomics approach

2020· article· en· W3034309595 sur OpenAlexaff
Scarlett Puebla-Barragan, Justin B. Renaud, Mark W. Sumarah, Gregor Reid

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueUrinary Tract Infections Management
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaLawson Health Research InstituteWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTrimethylamineCadaverineUrineUrinary systemPutrescineEscherichia coliTrimethylamine N-oxideMicrobiologyChemistryGenitourinary systemMedicineFood scienceBiologyInternal medicineBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many women suffer from urinary tract infections (UTIs). In addition to pain and increased urgency to urinate, malodour is a significant issue for these patients. The specific factors causing this malodour are unclear, and there are no targeted treatment options to counteract it effectively. We used a metabolomics approach to compare the chemical composition of metabolites in the urine of women with E. coli UTIs (n = 15) and those who are healthy (n = 10). The biogenic amines trimethylamine and putrescine, which cause malodour in other urogenital conditions, were significantly increased in UTI patients. Conversely, the precursor of trimethylamine, trimethylamine N-oxide, was lower. To further confirm the source of the malodorous compounds, in vitro experiments were conducted by incubating strains of uropathogenic E. coli in sterilized urine from healthy women. All tested strains accumulated trimethylamine and putrescine. Notably, cadaverine was also produced by E. coli strains in vitro; however, it was not significantly different between both groups. We confirmed that the malodorous amines TMA and putrescine are found in higher concentrations in the urine of patients with an E.coli-caused UTI.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,243
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations62
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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