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Enregistrement W3034425032 · doi:10.1126/science.abc5902

Potent neutralizing antibodies from COVID-19 patients define multiple targets of vulnerability

2020· article· en· W3034425032 sur OpenAlexaff
Philip J. M. Brouwer, Tom G. Caniels, Karlijn van der Straten, Jonne L. Snitselaar, Yoann Aldon, Sandhya Bangaru, Jonathan L. Torres, Nisreen M.A. Okba, Mathieu Claireaux, Gius Kerster, Arthur E. H. Bentlage, Marlies M. van Haaren, Denise Guerra, Judith A. Burger, Edith E. Schermer, Kirsten D. Verheul, Niels van der Velde, Alex van der Kooi, Jelle van Schooten, Mariëlle J. van Breemen, Tom P. L. Bijl, Kwinten Sliepen, Aafke Aartse, Ilja Bontjer, Neeltje A. Kootstra, W. Joost Wiersinga, Gestur Vidarsson, Bart L. Haagmans, Andrew B. Ward, Godelieve J. de Bree, Rogier W. Sanders, Marit J. van Gils

Notice bibliographique

RevueScience · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekUniversiteit van AmsterdamBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)2019-20 coronavirus outbreakVirologyAntibodyVulnerability (computing)Neutralizing antibodyBetacoronavirusCoronavirus InfectionsChemistryComputational biologyBiologyImmunologyMedicineComputer scienceComputer securityOutbreakInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The rapid spread of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has had a large impact on global health, travel, and economy. Therefore, preventative and therapeutic measures are urgently needed. Here, we isolated monoclonal antibodies from three convalescent coronavirus disease 2019 (COVID-19) patients using a SARS-CoV-2 stabilized prefusion spike protein. These antibodies had low levels of somatic hypermutation and showed a strong enrichment in VH1-69, VH3-30-3, and VH1-24 gene usage. A subset of the antibodies was able to potently inhibit authentic SARS-CoV-2 infection at a concentration as low as 0.007 micrograms per milliliter. Competition and electron microscopy studies illustrate that the SARS-CoV-2 spike protein contains multiple distinct antigenic sites, including several receptor-binding domain (RBD) epitopes as well as non-RBD epitopes. In addition to providing guidance for vaccine design, the antibodies described here are promising candidates for COVID-19 treatment and prevention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,084
Tête enseignante GPT0,370
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1 349
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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