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Enregistrement W3034456241 · doi:10.1101/2020.06.05.20114876

Impaired Th17 immunity in recurrent <i>C. difficile</i> infection is ameliorated by fecal microbial transplantation

2020· preprint· en· W3034456241 sur OpenAlexafffund
Laura Cook, William D. Rees, May Q. Wong, Xiaojiao Wang, Hannah Peters, Laura Oliveira, Torey Lau, Regan Mah, Brian Bressler, R. Gómez, I‐Ting Chow, Eddie A. James, William W. Kwok, Megan K. Levings, Theodore S. Steiner

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensCanadian Society of Intestinal ResearchBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesSanofi PasteurCanadian Institutes of Health ResearchMerck CanadaAdaptive BiotechnologiesBC Children's HospitalSanofiPfizerBristol-Myers Squibb
Mots-clésImmunologyAntibodyImmunityMedicineClostridium difficileImmune systemFlow cytometryT cellDiseaseClostridium difficile toxin ABiologyMicrobiologyVirologyInternal medicineAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Background & Aims Clostridioides difficile is a leading cause of infectious diarrhea and an urgent antimicrobial resistant threat. Symptoms are caused by its toxins, TcdA and TcdB, with many patients developing recurrent C. difficile infection (CDI), requiring fecal microbiota transplant (FMT). Antibody levels have not been useful in predicting patient outcomes, which is an unmet need. We aimed to characterize T cell-mediated immunity to C. difficile toxins and assess how these responses were affected by FMT. Methods We obtained blood samples from patients with newly acquired CDI, recurrent CDI (with a subset receiving FMT), inflammatory bowel disease with no history of CDI, and healthy individuals (controls). Toxin-specific CD4 + T cell responses were analysed using a whole blood flow cytometry antigen-induced marker assay. Serum antibodies were measured by ELISA. Tetramer guided mapping was used to identify HLA-II-restricted TcdB epitopes and DNA was extracted from TcdB-specific CD4 + T cells for TCR repertoire analysis by Sanger sequencing. Results CD4 + T cell responses to C. difficile toxins were functionally diverse. Compared to controls, individuals with CDI, or inflammatory bowel disease had significantly higher frequencies of TcdB-specific CD4 + T cells. Subjects with recurrent CDI had reduced proportions of TcdB-specific CD4 + Th17 cells, FMT reversed this deficit and increased toxin-specific antibody production. Conclusions These data suggest that effective T cell immunity to C. difficile requires the development of Th17 cells. In addition, they show that an unknown aspect of the therapeutic effect of FMT may be enhanced T and B cell-mediated immunity to TcdB. GRAPHICAL ABSTRACT

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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