A molecular marker for, and the organization of, a cluster of loose smut resistance genes in oat
Notice bibliographique
Résumé
Loose smut (Ustilago avenae) resistance breeding is hampered by the many distinct smut races, and the different, poorly characterized resistance genes. Three pathotypes (A13, A60, A617) represent the most common races present in the prairie regions of western Canada (Kibite et al. 2000). Markers linked to a group of smut resistance genes located on linkage group 14 (Kanota/ Ogle) have been developed (Eckstein et al. 2002). One co-dominant SCAR marker was used to study the relationship between the marker and the three resistance genes. Molecular markers and plant populations used were described in Eckstein et al. (2002). Another population (OT369/89Ab4088) segregating for the three genes was also evaluated. All lines were inoculated with separate isolates of A13, A60, and A617 using a vacuum protocol, and grown over several locations and years in western Canada. SCAR marker Ua300co (co-dominant) was linked (~ 5 cM) to a resistance gene specific for pathotype A13. Two other pathotype specific genes clustered on the same side of the marker at genetic distances of 8 cM (A617) and 18 cM (A60). The genes are linked in coupling and are likely often inherited as a group. Attempts to find a flanking marker for the cluster are in progress. Eckstein et al. 2002. In: American Oat Workers Conference, Wilmington, NC, USA, May 5-7, 2002. pp33; Kibite et al. 2000. In: Cross, R.J. (ed). Proceedings of the 6th International Oat Conference, Lincoln, NZ. November 13-16 2000. pp298-301.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».