<i>SETD1B</i>-associated neurodevelopmental disorder
Notice bibliographique
Résumé
Background Dysfunction of histone methyltransferases and chromatin modifiers has been implicated in complex neurodevelopmental syndromes and cancers. SETD1B encodes a lysine-specific methyltransferase that assists in transcriptional activation of genes by depositing H3K4 methyl marks. Previous reports of patients with rare variants in SETD1B describe a distinctive phenotype that includes seizures, global developmental delay and intellectual disability. Methods Two of the patients described herein were identified via genome-wide and exome-wide testing, with microarray and research-based exome, through the CAUSES (Clinical Assessment of the Utility of Sequencing and Evaluation as a Service) Research Clinic at the University of British Columbia. The third Vancouver patient had clinical trio exome sequencing through Blueprint Genetics. The fourth patient underwent singleton exome sequencing in Nantes, with subsequent recruitment to this cohort through GeneMatcher. Results Here we present clinical reports of four patients with rare coding variants in SETD1B that demonstrate a shared phenotype, including intellectual disability, language delay, conserved musculoskeletal findings and seizures that may be treatment-refractory. We include supporting evidence from next-generation sequencing among a cohort of paediatric patients with epilepsy. Conclusion Rare coding variants in SETD1B can cause a diagnosable syndrome and could contribute as a risk factor for epilepsy, autism and other neurodevelopmental phenotypes. In the long term, some patients may also be at increased risk for cancers and other complex diseases. Thus, longitudinal studies are required to further elucidate the precise role of SETD1B in neurodevelopmental disorders and other systemic disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,009 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».