MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3034765536 · doi:10.1016/j.puhe.2020.06.006

Test, test, test for COVID-19 antibodies: the importance of sensitivity, specificity and predictive powers

2020· article· en· W3034765536 sur OpenAlexaff
N. Kumleben, Raj Bhopal, Thomas Czypionka, Laurence Gruer, Richard Kock, Justin Stebbing, Florian Stigler

Notice bibliographique

RevuePublic Health · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensCentre for Global Health Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFalse positive paradoxMedicineTest (biology)PopulationOutbreakVirologyStatisticsEnvironmental healthBiologyMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) antibody tests of varying specificity and sensitivity are now available. For informing individuals whether they have had coronavirus disease 2019 (COVID-19), they need to be very accurate. For measuring population prevalence of past infection, the numbers of false positives and negatives need to be roughly equal. With a series of worked examples for a notional population of 100,000 people, we show that even test systems with a high specificity can yield a large number of false positive results, especially where the population prevalence is low. For example, at a true population prevalence of 5%, using a test with 99% sensitivity and specificity, 16% of positive results will be false and thus 950 people will be incorrectly informed they have had the infection. Further confirmatory testing may be needed. Giving false reassurance on which personal or societal decisions might be based could be harmful for individuals, undermine public confidence and foster further outbreaks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,067
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,161
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,933
Score d'incertitude au seuil0,354

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0670,161
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,001
Bibliométrie0,0070,002
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0050,005
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0040,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,112
Tête enseignante GPT0,393
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentnon

Explorer davantage

Même revuePublic HealthMême sujetSARS-CoV-2 and COVID-19 ResearchTravaux en français237 207