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Enregistrement W3034856270 · doi:10.1101/2020.06.14.150854

Binding of Calcium and Magnesium to Cardiac Troponin C

2020· preprint· en· W3034856270 sur OpenAlexaff
Kaveh Rayani, JT Seffernick, Alison Yueh Li, JP Davis, AM Spuches, Filip Van Petegem, RJ Solaro, Steffen Lindert, Glen F. Tibbits

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British ColumbiaSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryBinding siteIsothermal titration calorimetryCalciumBiophysicsMagnesiumPopulationTitrationTroponinBiochemistryInternal medicineBiologyMedicineInorganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Cardiac troponin C (cTnC) is the Ca 2+ -sensing component of the thin filament. It contains structural sites (III/IV) which bind both Ca 2+ and Mg 2+ , and a regulatory site (II) that has been thought to bind only Ca 2+ . The latter binding initiates a series of conformational changes that culminate in force production. We have quantified the interaction between site II and Ca 2+ /Mg 2+ through Isothermal Titration Calorimetry and Thermodynamic Integration simulations. Direct and competitive binding titrations using wild type and a double mutant that significantly reduces binding to site II demonstrated that physiologically relevant concentrations of both Ca 2+ /Mg 2+ interact with the same locus. Cytosolic free Mg 2+ (~1 mM) could occupy a significant population of available site II, as this concentration of Mg 2+ decreased the affinity for Ca 2+ 1.4-fold. Interaction of Mg 2+ with site II of cTnC likely has important functional consequences for the heart at baseline and in diseased states which decrease or increase availability of Mg 2+ such as secondary hyperparathyroidism or ischemia, respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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