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Enregistrement W3034864722 · doi:10.1002/wrna.1609

<scp>tRNA</scp> methylation: An unexpected link to bacterial resistance and persistence to antibiotics and beyond

2020· review· en· W3034864722 sur OpenAlexaff
Ya‐Ming Hou, Isao Masuda, Leonard J. Foster

Notice bibliographique

RevueWiley Interdisciplinary Reviews - RNA · 2020
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of General Medical SciencesNational Human Genome Research InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésMethylationTransfer RNABiologyBacteriaEffluxRNATranslation (biology)Bacterial cell structureProtein biosynthesisCell envelopeGeneticsMessenger RNAGeneEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract A major threat to public health is the resistance and persistence of Gram‐negative bacteria to multiple drugs during antibiotic treatment. The resistance is due to the ability of these bacteria to block antibiotics from permeating into and accumulating inside the cell, while the persistence is due to the ability of these bacteria to enter into a nonreplicating state that shuts down major metabolic pathways but remains active in drug efflux. Resistance and persistence are permitted by the unique cell envelope structure of Gram‐negative bacteria, which consists of both an outer and an inner membrane (OM and IM, respectively) that lay above and below the cell wall. Unexpectedly, recent work reveals that m1G37 methylation of tRNA, at the N1 of guanosine at position 37 on the 3′‐side of the tRNA anticodon, controls biosynthesis of both membranes and determines the integrity of cell envelope structure, thus providing a novel link to the development of bacterial resistance and persistence to antibiotics. The impact of m1G37‐tRNA methylation on Gram‐negative bacteria can reach further, by determining the ability of these bacteria to exit from the persistence state when the antibiotic treatment is removed. These conceptual advances raise the possibility that successful targeting of m1G37‐tRNA methylation can provide new approaches for treating acute and chronic infections caused by Gram‐negative bacteria. This article is categorized under: Translation > Translation Regulation RNA Processing > RNA Editing and Modification RNA Structure and Dynamics > Influence of RNA Structure in Biological Systems

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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