Serotype Replacement After the Introduction of the 13-valent Pneumococcal Conjugate Vaccine in Ontario, Canada, 2007-2018
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: Invasive pneumococcal disease (IPD) is a disease of public health significance in Ontario, Canada, where publicly funded pneumococcal vaccination programs target children, older adults, and people at high risk of disease. Since the implementation of pneumococcal conjugate vaccines (PCV), serotype replacement has been documented, where non-PCV serotypes replace the niche created by the reduction in vaccine-preventable serotypes. Our objective was to determine whether there has been serotype replacement or a change in IPD severity in Ontario since implementation of the childhood 13-valent (PCV13) program by assessing IPD burden over a 12-year period (2007-2018). Methods: We included all confirmed IPD cases reported in Ontario’s integrated Public Health Information System (iPHIS) and defined the pre-PCV13 era (January 2007-December 2010) and post-PCV13 era (January 2011-December 2018). We grouped IPD serotypes according to associated vaccine type: PCV13; 23-valent polysaccharide vaccine (unique PPV23); and non-vaccine-preventable (NVP). We used population data to calculate incidence and hospitalization rates (per 100,000 population) by age group, vaccine type, and era. Results: In the post-PCV13 era, PCV13-specific incidence and hospitalization rates decreased, while the incidence and hospitalizations due to unique PPV23 and NVP serotypes increased; this was consistent across all age groups. The greatest decrease in incidence (RR=0.4) and hospitalizations (RR=0.4) was observed in children <5 years with PCV13 serotypes. There were no distinct age-related trends observed for case fatality ratios; the highest CFR was observed in adults ≥65 years. Conclusion: A shift in serotype distribution was seen across all age groups; IPD incidence and hospitalization rates due to PCV13 serotypes decreased after PCV13 implementation, but this reduction was offset by the increasing burden and severity of unique PPV23 and NVP serotypes. As IPD continues to be a severe disease, continued surveillance is required to better understand the growing burden of these serotypes and emergence of non-vaccine-preventable serotypes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».