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Enregistrement W3034964388 · doi:10.1109/jstsp.2020.3001525

Enhanced Deep-Learning-Based Magnetic Resonance Image Reconstruction by Leveraging Prior Subject-Specific Brain Imaging: Proof-of-Concept Using a Cohort of Presumed Normal Subjects

2020· article· en· W3034964388 sur OpenAlexaff
Roberto Souza, Youssef Beauferris, Wallace Souza Loos, R. Marc Lebel, Richard Frayne

Notice bibliographique

RevueIEEE Journal of Selected Topics in Signal Processing · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced MRI Techniques and Applications
Établissements canadiensGeneral Electric (Canada)Foothills Medical CentreUniversity of CalgaryAlberta Health Services
Organismes subventionnairesScience and Engineering Research Council
Mots-clésArtificial intelligenceComputer scienceIterative reconstructionWilcoxon signed-rank testMagnetic resonance imagingNeuroimagingImage qualityPattern recognition (psychology)Deep learningComputer visionSimilarity (geometry)Mean squared errorNuclear medicineMathematicsImage (mathematics)MedicineStatisticsRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Deep learning models have shown potential for reconstructing undersampled, multi-channel magnetic resonance (MR) image acquisitions. Recently proposed methods, however, have not leveraged information from prior subject-specific MR imaging sessions. Such data are often readily available through a picture archiving and communication system (PACS). We propose a flexible three-step method to incorporate this prior information into an enhanced deep-learning-based reconstruction process. The method consists of Step 1: an initial reconstruction; Step 2: registration of the previous scan to the initial reconstruction; and Step 3: an enhancement network. Training and testing used longitudinally acquired, three-dimensional, T1-weighted brain images acquired with different acquisition parameters. We tested our networks using data from 2808 images (obtained in 18 subjects) under four different acceleration factors (R = {5, 10, 15, 20}). Our enhanced reconstruction (Steps 1-3) produced higher-quality images: structural similarity and peak signal-to-noise ratio increased, and normalized root mean squared error decreased on average by 16.5%, 7.0% and 21.1%, respectively, compared to the nonenhanced reconstruction (Step 1 only) under the same network capacity as the enhanced reconstruction model. These differences were statistically significant (p <; 0.001, Wilcoxon signed-rank test). Further volumetric analysis performed on key brain regions (brain, white matter, gray matter and cortex) indicated that our enhanced images had better volume agreement with the fully sampled reference images compared to the non-enhanced images. hanced images for R = 20 were comparable to the non-enhanced images for R = 10 demonstrating that our proposed method use prior scan information to further accelerate MR examinations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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