Identification and mapping of central pair proteins by proteomic analysis
Notice bibliographique
Résumé
Cilia or flagella of eukaryotes are small micro-hair like structures that are indispensable to single-cell motility and play an important role in mammalian biological processes. Cilia or flagella are composed of nine doublet microtubules surrounding a pair of singlet microtubules called the central pair (CP). Together, this arrangement forms a canonical and highly conserved 9+2 axonemal structure. The CP, which is a unique structure exclusive to motile cilia, is a pair of structurally dimorphic singlet microtubules decorated with numerous associated proteins. Mutations of CP-associated proteins cause several different physical symptoms termed as ciliopathies. Thus, it is crucial to understand the architecture of the CP. However, the protein composition of the CP was poorly understood. This was because the traditional method of identification of CP proteins was mostly limited by available Chlamydomonas mutants of CP proteins. Recently, more CP protein candidates were presented based on mass spectrometry results, but most of these proteins were not validated. In this study, we re-evaluated the CP proteins by conducting a similar comprehensive CP proteome analysis comparing the mass spectrometry results of the axoneme sample prepared from Chlamydomonas strains with and without CP complex. We identified a similar set of CP protein candidates and additional new 11 CP protein candidates. Furthermore, by using Chlamydomonas strains lacking specific CP sub-structures, we present a more complete model of localization for these CP proteins. This work has established a new foundation for understanding the function of the CP complex in future studies.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».