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Enregistrement W3035338681 · doi:10.2337/db20-95-or

95-OR: Plasma miRNAs Levels at First Trimester of Pregnancy Predict Insulin Sensitivity Estimated at the Second Trimester of Pregnancy

2020· article· en· W3035338681 sur OpenAlexaff
Cécilia Légaré, Véronique Desgagné, Frédérique White, Michelle S. Scott, Patrice Perron, Marie‐France Hivert, Renée Guérin, Luigi Bouchard

Notice bibliographique

RevueDiabetes · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePregnancy and preeclampsia studies
Établissements canadiensCégep de Chicoutimi
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPregnancyGestational diabetesmicroRNAMedicineObstetricsGestational ageCohortGestationEndocrinologyBiologyInternal medicineBioinformaticsGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Gestational diabetes mellitus (GDM) is the most common pregnancy complication with a prevalence of 14% worldwide and has important consequences on both the mother and her child. GDM results from imbalance between insulin secretion capacity response and decreasing insulin sensitivity in pregnancy. MicroRNAs (miRNAs) are small (19-24nt) single-stranded RNA molecules involved in post-transcriptional regulation through binding to targeted mRNAs. MiRNAs are thought to regulate many physiological processes including glucose homeostasis. Objective: Identify plasmatic miRNAs at the first trimester of pregnancy that predict insulin sensitivity (IS; as estimated with the Matsuda index) assessed between the 24th and the 28thweek of pregnancy. Methods: miRNAs were quantified by next generation sequencing in 443 plasma samples from the Gen3G birth-cohort. DESeq2 package was applied to identify miRNAs associated with IS. Glmnet package was used to compute lasso regression and find the minimum number of miRNAs predicting IS. Results: On average, participants were 28.43 ± 4.3 (18-47) years old and had a BMI of 26.1 ± 6.1 (16.6-54.1) kg/m2 at first trimester and had a Matsuda index of 8.41 ± 4.9 (0.77-37.53) at second trimester. A total of 106 miRNAs were associated with IS (p-adjusted for false discovery rate <0.1) when analyses were corrected for gestational age at blood collection, with 37 of them remaining significant after further correction for maternal age and BMI measured at first trimester. A lasso regression selected 27 of these miRNAs along with maternal age and BMI and overall explained 32% of the variability of IS at second trimester. Conclusion: miRNAs quantified at first trimester of pregnancy are associated with and predictive of maternal IS estimated at second trimester. These miRNAs are likely involved in the pathophysiology of GDM and provide novel promising biomarkers for predicting glucose metabolism dysregulation in pregnancy. Disclosure C. Légaré: None. V. Desgagné: None. F. White: None. M.S. Scott: None. P. Perron: None. M. Hivert: None. R. Guérin: None. L. Bouchard: None. Funding IRSC (IGH-155183)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,015
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,072

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,015
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0210,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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