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Enregistrement W3035406574 · doi:10.1101/2020.06.09.143438

A potent synthetic nanobody targets RBD and protects mice from SARS-CoV-2 infection

2020· preprint· en· W3035406574 sur OpenAlexaff
Tingting Li, Hongmin Cai, Hebang Yao, Bingjie Zhou, Ning Zhang, Yuhuan Gong, Yapei Zhao, Quan Shen, Wenming Qin, Cedric A. J. Hutter, Yanling Lai, Shu-Ming Kuo, Juan Bao, Jiaming Lan, Markus A. Seeger, Gary Wong, Yuhai Bi, Dimitri Lavillette, Dianfan Li

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesYouth Innovation Promotion AssociationNational Natural Science Foundation of ChinaSalt Science Research FoundationSoochow UniversityNatural Science Foundation of Shanghai
Mots-clésNeutralizationAntibodyPotencyDivalentIn vitroSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)ChemistryCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Neutralizing antibodyVirologyBiologyBiochemistryMedicineImmunologyDiseaseInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT SARS-CoV-2, the causative agent of COVID-19 1 , recognizes host cells by attaching its receptor-binding domain (RBD) to the host receptor ACE2 2–7 . Neutralizing antibodies that block RBD-ACE2 interaction have been a major focus for therapeutic development 8–18 . Llama-derived single-domain antibodies (nanobodies, ∼15 kDa) offer advantages including ease of production and possibility for direct delivery to the lungs by nebulization 19 , which are attractive features for bio-drugs against the global respiratory disease. Here, we generated 99 synthetic nanobodies (sybodies) by in vitro selection using three libraries. The best sybody, MR3 bound to RBD with high affinity ( K D = 1.0 nM) and showed high neutralization activity against SARS-CoV-2 pseudoviruses (IC 50 = 0.40 μg mL −1 ). Structural, biochemical, and biological characterization of sybodies suggest a common neutralizing mechanism, in which the RBD-ACE2 interaction is competitively inhibited by sybodies. Various forms of sybodies with improved potency were generated by structure-based design, biparatopic construction, and divalent engineering. Among these, a divalent MR3 conjugated with the albumin-binding domain for prolonged half-life displayed highest potency (IC 50 = 12 ng mL −1 ) and protected mice from live SARS-CoV-2 challenge. Our results pave the way to the development of therapeutic nanobodies against COVID-19 and present a strategy for rapid responses for future outbreaks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,161
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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