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Enregistrement W3035554388 · doi:10.1017/s0029665120000282

Combined LC-MS and <sup>1</sup>H-NMR metabolomic profiling uncovers dietary biomarkers in a cohort of healthy Northern Irish older adults:

2020· article· en· W3035554388 sur OpenAlexaboutno aff
Gonçalo Rosas da Silva, Stewart F. Graham, Ali Yılmaz, Zafer Ugur, Ian Young, Frank Kee, Charlotte E. Neville, Jayne V. Woodside, Brian D. Green

Notice bibliographique

RevueProceedings of The Nutrition Society · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEconomic and Social Research Council
Mots-clésCohortMetabolomicsMetabolomeMetaboliteIngestionFood scienceMedicineChemistryAnimal scienceInternal medicineChromatographyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract A longstanding issue in the field of nutrition is the potential inaccuracy of methods traditionally used for dietary assessment (i.e. food diaries and food frequency questionnaires). It is possible to overcome the limitations and biases of these techniques by combining them with analytical measurements in human biofluids. Metabolomic technologies are gaining popularity as nutritional tools due to their capacity to measure metabolic responses to external stimuli, such as the ingestion of certain foods. This project performed both LC-MS and 1 H-NMR metabolomic profiling on serum samples collected as part of the NICOLA study (Northern Irish Cohort for the Longitudinal Study of Aging) in order to discover novel dietary biomarkers. A dietary validation cohort (NIDAS) was incorporated within NICOLA, involving 45 males and 50 females, aged 50 years and over. Participants provided detailed dietary data (4-day food diary) and blood samples at two time-points, six months apart. Serum samples were processed on two analytical platforms. 1 H-NMR spectra were acquired using a Bruker 600 MHz Ascent coupled to a TCI cryoprobe and processed using Bayesil (University of Alberta, Canada). A Waters TQ-S coupled with an Acquity I-class UPLC was used in combination with a targeted commercially available kit (AbsoluteIDQ p180 kit, Biocrates). Mass spectra obtained were processed with MetIDQ and verified using MassLynx (v4.1). Data were tested for normality, and metabolite concentrations were correlated with recorded dietary intake of each food type using SPSS. Additional tests (PCA, PLS-DA, ROC Curves) were performed on MetaboAnalyst 4.0 (University of Alberta, Canada). More than 50 statistically significant (P &lt; 0.05) food-metabolite correlations were detected, 15 of which remained significant after eliminating potential confounding from sex, age and BMI. The strongest correlations were between fruit consumption and acetic acid, and between dairy consumption and certain glycerophospholipids (e.g. LysoPC aa C20:3). Stratifying the cohort by gender yielded further correlations, including PC ae C38:2 (dairy; males), PC aa C34:4 (dairy; females), PC aa C36:4 (dairy; females) and trans-4-Hydroxyproline (meat; males). A number of potential blood-based food biomarkers were detected, many of which are gender-specific, and some are corroborated by previously published studies. However, further validation work is required. For example, biological plausibility needs to be established, and the findings need to be reproduced in other cohorts to demonstrate their applicability in larger and more diverse populations. These results contribute greatly to the ongoing efforts to discover and validate reliable nutritional biomarkers as an objective and unbiased measurement of food intake.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,378
Score d'incertitude au seuil0,593

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
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