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Enregistrement W3035587281 · doi:10.1093/jncics/pkaa050

Systematic Review and STARD Scoring of Renal Cell Carcinoma Circulating Diagnostic Biomarker Manuscripts

2020· review· en· W3035587281 sur OpenAlexaff
Marco Iafolla, Sarah Picardo, Kyaw Aung, Aaron R. Hansen

Notice bibliographique

RevueJNCI Cancer Spectrum · 2020
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal cell carcinoma treatment
Établissements canadiensWilliam Osler Health SystemPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineRenal cell carcinomaBiomarkerMEDLINEDiagnostic accuracyInternal medicineDiagnostic biomarkerOncologyMedical physics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background No validated molecular biomarkers exist to help guide diagnosis of renal cell carcinoma (RCC) patients. We seek to evaluate the quality of published RCC circulating diagnostic biomarker manuscripts using the Standards for Reporting of Diagnostic Accuracy Studies (STARD) guidelines. Methods The phrase “(renal cell carcinoma OR renal cancer OR kidney cancer OR kidney carcinoma) AND circulating AND (biomarkers OR cell free DNA OR tumor DNA OR methylated cell free DNA OR methylated tumor DNA)” was searched in Embase, MEDLINE, and PubMed in March 2018. Relevant manuscripts were scored using 41 STARD subcriteria for a maximal score of 26 points. All tests of statistical significance were 2 sided. Results The search identified 535 publications: 27 manuscripts of primary research were analyzed. The median STARD score was 11.5 (range = 7-16.75). All manuscripts had appropriate abstracts, introductions, and distribution of alternative diagnoses. None of the manuscripts stated how indeterminant data were handled or if adverse events occurred from performing the index test or reference standard. Statistically significantly higher STARD scores were present in manuscripts reporting receiver operator characteristic curves (P < .001), larger sample sizes (P = .007), and after release of the original STARD statement (P = .005). Conclusions Most RCC circulating diagnostic biomarker manuscripts poorly adhere to the STARD guidelines. Future studies adhering to STARD guidelines may address this unmet need.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,053
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,270
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,947
Score d'incertitude au seuil0,281

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0530,270
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0090,008
Bibliométrie0,0340,030
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0060,005
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeRevue systématique
DomainePrésentation des résultats
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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