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Enregistrement W3035779321 · doi:10.1073/pnas.1920483117

Bacterial metabolism rescues the inhibition of intestinal drug absorption by food and drug additives

2020· article· en· W3035779321 sur OpenAlexfundno aff
Ling Zou, Peter Spanogiannopoulos, Lindsey M. Pieper, Huan‐Chieh Chien, Wenlong Cai, Natalia Khuri, Joshua Pottel, Bianca Vora, Zhanglin Ni, Eleftheria Tsakalozou, Wenjun Zhang, Brian K. Shoichet, Kathleen M. Giacomini, Peter J. Turnbaugh

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Cancer InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteU.S. Food and Drug Administration
Mots-clésDrugExcipientDrug metabolismPharmacologyChemistryAbsorption (acoustics)In vivoMetabolismBiochemistryBiologyBiotechnology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Food and drug products contain diverse and abundant small-molecule additives (excipients) with unclear impacts on human physiology, drug safety, and response. Here, we evaluate their potential impact on intestinal drug absorption. By screening 136 unique compounds for inhibition of the key intestinal transporter OATP2B1 we identified and validated 24 potent OATP2B1 inhibitors, characterized by higher molecular weight and hydrophobicity compared to poor or noninhibitors. OATP2B1 inhibitors were also enriched for dyes, including 8 azo (R-N=N-R') dyes. Pharmacokinetic studies in mice confirmed that FD&C Red No. 40, a common azo dye excipient and a potent inhibitor of OATP2B1, decreased the plasma level of the OATP2B1 substrate fexofenadine, suggesting that FD&C Red No. 40 has the potential to block drug absorption through OATP2B1 inhibition in vivo. However, the gut microbiomes of multiple unrelated healthy individuals as well as diverse human gut bacterial isolates were capable of inactivating the identified azo dye excipients, producing metabolites that no longer inhibit OATP2B1 transport. These results support a beneficial role for the microbiome in limiting the unintended effects of food and drug additives in the intestine and provide a framework for the data-driven selection of excipients. Furthermore, the ubiquity and genetic diversity of gut bacterial azoreductases coupled to experiments in conventionally raised and gnotobiotic mice suggest that variations in gut microbial community structure may be less important to consider relative to the high concentrations of azo dyes in food products, which have the potential to saturate gut bacterial enzymatic activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations60
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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