Genetic assays for guano-based identification of species and sex in bats of the United States and Canada
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Bat guano is a noninvasive, data-rich genetic resource. However, the constituent bat DNA is relatively scant, degraded, and complexed with polymerase chain reaction inhibitors. It also is comingled with a rich pool of nontarget DNA from microbes, parasites, and dietary items. We designed and tested new DNA assays for bat species identification (COX1-Bat) and sex identification (XGXYC) for use with guano and other challenging samples. We reviewed previously published assays that can be used with guano samples to obtain the same species and sex data, and attempted to validate these assays for species in which they had not previously been tested. Our results demonstrate that guano-derived DNA can be used successfully to 1) identify nearly all US and Canadian bats at the species level, or to one of three Myotis species clusters, and 2) identify the sex of at least 23 US and Canadian bat species. Our newly developed assays, and validation of previously published assays, for guano-based identification of species and sex in bats, significantly enhance the power of noninvasive sampling and genetic analysis for bat studies, management, and conservation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».