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Enregistrement W3035822975 · doi:10.1186/s40478-020-00966-x

A novel mechanism of phenotypic heterogeneity in Creutzfeldt-Jakob disease

2020· article· en· W3035822975 sur OpenAlexaff
Satish Kumar Nemani, Xiangzhu Xiao, Ignazio Calì, Laura Cracco, Gianfranco Puoti, M. Nigro, Jody Lavrich, Anuradha Singh, Brian S. Appleby, Valerie L. Sim, Silvio Notari, Witold K. Surewicz, Pierluigi Gambetti

Notice bibliographique

RevueActa Neuropathologica Communications · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Center for Emerging and Zoonotic Infectious DiseasesNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCenters for Disease Control and PreventionNational Institutes of Health
Mots-clésPhenotypeBiologyGenetic heterogeneityGeneticsGeneGenotypeKuruDiseaseScrapiePrion proteinVirologyPathologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract One of remarkable features of sporadic Creutzfeldt-Jakob disease (sCJD) is the great phenotypic variability. Understanding the molecular basis of this variability has important implications for the development of therapeutic approaches. It is well established that, in many cases, phenotypic heterogeneity of sCJD is under control of two determinants: the genotype at the methionine (M)/valine (V) polymorphic codon 129 of the human prion protein gene and the type, 1 or 2, of the pathogenic and disease-related form of the prion protein, PrP D . However, this scenario fails to explain the existence of distinct heterozygous sCJDMV2 subtypes, where heterogeneity occurs without any variation of the 129 allotype and PrP D type. One of these subtypes, denoted sCJDMV2C, associated with PrP D type 2, is characterized by widespread spongiform degeneration of the cerebral cortex (C). The second variant, denoted sCJDMV2K, features prominent deposition of PrP D amyloid forming kuru type (K) plaques. Here we used a mass spectrometry based approach to test the hypothesis that phenotypic variability within the sCJDMV2 subtype is at least partly determined by the abundance of 129 M and 129 V polymorphic forms of proteinase K-resistant PrP D (resPrP D ). Consistent with this hypothesis, our data demonstrated a strong correlation of the MV2C and MV2K phenotypes with the relative populations of protease-resistant forms of the pathogenic prion proteins, resPrP D -129 M and resPrP D -129 V, where resPrP D -129 M dominated in the sCJDMV2C variant and resPrP D -129 V in the sCJDMV2K variant. This finding suggests an important, previously unrecognized mechanism for phenotypic determination in human prion diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,657
Score d'incertitude au seuil0,488

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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