Functional Microbiomics Reveals Alterations of the Gut Microbiome and Host Co‐Metabolism in Patients With Alcoholic Hepatitis
Notice bibliographique
Résumé
Alcohol‐related liver disease is a major public health burden, and the gut microbiota is an important contributor to disease pathogenesis. The aim of the present study is to characterize functional alterations of the gut microbiota and test their performance for short‐term mortality prediction in patients with alcoholic hepatitis. We integrated shotgun metagenomics with untargeted metabolomics to investigate functional alterations of the gut microbiota and host co‐metabolism in a multicenter cohort of patients with alcoholic hepatitis. Profound changes were found in the gut microbial composition, functional metagenome, serum, and fecal metabolomes in patients with alcoholic hepatitis compared with nonalcoholic controls. We demonstrate that in comparison with single omics alone, the performance to predict 30‐day mortality was improved when combining microbial pathways with respective serum metabolites in patients with alcoholic hepatitis. The area under the receiver operating curve was higher than 0.85 for the tryptophan, isoleucine, and methionine pathways as predictors for 30‐day mortality, but achieved 0.989 for using the urea cycle pathway in combination with serum urea, with a bias‐corrected prediction error of 0.083 when using leave‐one‐out cross validation. Conclusion: Our study reveals changes in key microbial metabolic pathways associated with disease severity that predict short‐term mortality in our cohort of patients with alcoholic hepatitis.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».