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Enregistrement W3036205451 · doi:10.1038/s41597-020-0533-4

Massive online data annotation, crowdsourcing to generate high quality sleep spindle annotations from EEG data

2020· article· en· W3036205451 sur OpenAlexafffund
Karine Lacourse, Benjamin D. Yetton, Sara C. Mednick, Simon C. Warby

Notice bibliographique

RevueScientific Data · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueObstructive Sleep Apnea Research
Établissements canadiensUniversité de MontréalCanadian Sleep & Circadian Network
Organismes subventionnairesCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCrowdsourcingAnnotationComputer scienceElectroencephalographyData qualityQuality (philosophy)MetadataInformation retrievalData scienceWorld Wide WebArtificial intelligenceBiologyNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Spindle event detection is a key component in analyzing human sleep. However, detection of these oscillatory patterns by experts is time consuming and costly. Automated detection algorithms are cost efficient and reproducible but require robust datasets to be trained and validated. Using the MODA (Massive Online Data Annotation) platform, we used crowdsourcing to produce a large open-source dataset of high quality, human-scored sleep spindles (5342 spindles, from 180 subjects). We evaluated the performance of three subtype scorers: "experts, researchers and non-experts", as well as 7 previously published spindle detection algorithms. Our findings show that only two algorithms had performance scores similar to human experts. Furthermore, the human scorers agreed on the average spindle characteristics (density, duration and amplitude), but there were significant age and sex differences (also observed in the set of detected spindles). This study demonstrates how the MODA platform can be used to generate a highly valid open source standardized dataset for researchers to train, validate and compare automated detectors of biological signals such as the EEG.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Science ouverte, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesScience ouverte, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,537
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0070,012
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,278
Tête enseignante GPT0,427
Écart entre enseignants0,149 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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