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Enregistrement W3036209217 · doi:10.1021/acs.bioconjchem.0c00267

Enabling Indium Channels for Mass Cytometry by Using Reinforced Cyclam-Based Chelating Polylysine

2020· article· en· W3036209217 sur OpenAlexaff
Laura Grenier, Maryline Beyler, Taunia Closson, Nick Zabinyakov, Alexandre Bouzekri, Yefeng Zhang, Jothir Mayanantham Pichaandi, Mitchell A. Winnik, Peng Liu, Olga Ornatsky, Vladimir Baranov, Raphaël Tripier

Notice bibliographique

RevueBioconjugate Chemistry · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensUniversity of TorontoFluidigm (Canada)
Organismes subventionnairesRégion BretagneCentre National de la Recherche Scientifique
Mots-clésChemistryPolylysineMass cytometryFlow cytometryBiotinylationJurkat cellsMolecular biologyBiophysicsChromatographyBiochemistryImmunologyT cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The synthesis of a polylysine polymer functionalized with the previously reported astonishingly inert [In( cb-te2pa )] + chelate was performed. A biotin end group allowed the conjugation to biotinylated beads by the intermediary of a fluorescein isothiocyanate/neutravidin receptor. High quality imaging mass cytometry trials, based on 115 In detection were performed to highlight the behavior of the material. Anti-CD20 antibody was labeled by the so-obtained In(III)-modified polylysine using the biotin/neutravidin interaction. Ramos (CD20[+]) and HL-60 (CD20[−]) cell lines were costained with the In(III)-modified bioconjugate by finding the best staining conditions. Both immunofluorescence microscopy (IF-M) and mass cytometry analyses confirmed the specific binding of anti-CD20 onto Ramos cells. CyTOF histograms constructed on the 115 In detection allowed us to define and to separate, with a good signal-to-noise ratio, two populations (Ramos and HL-60). The inertness of In(III)-MCP-NAv over a three-month storage period was proved by performing new functionality tests involving Jurkat cells (CD20[−]) and multiparametric trials involving the 115 In channel. The results ensure a promising future use of the previously announced [In( cb-te2pa )] + complex-based polymers for mass cytometry.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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