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Enregistrement W3036234875 · doi:10.1021/acs.analchem.0c01370

Targeting the Lowest Concentration of a Toxin That Induces a Detectable Metabolic Response in Living Organisms: Time-Resolved <i>In Vivo</i> 2D NMR during a Concentration Ramp

2020· article· en· W3036234875 sur OpenAlexafffund
Daniel Lane, Wolfgang Bermel, Paris Ning, Tae‐Yong Jeong, Richard D. Martin, Ronald Soong, Bing Wu, Maryam Tabatabaei-Anaraki, Hermann Heumann, Marcel Gundy, Holger Boenisch, Antonio Adamo, George B. Arhonditsis, André J. Simpson

Notice bibliographique

RevueAnalytical Chemistry · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensThe Scarborough HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Ministry of Research, Innovation and ScienceKrembil FoundationCanada Foundation for InnovationGovernment of Ontario
Mots-clésChemistryIn vivoToxinBiophysicsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In vivo nuclear magnetic resonance (NMR) is a powerful analytical tool for probing complex biological processes inside living organisms. However, due to magnetic susceptibility broadening, which produces broad lines in one-dimensional NMR, 1H–13C two-dimensional (2D) NMR is required for metabolite monitoring in vivo. As each 2D experiment is time-consuming, often hours, this limits the temporal resolution over which in vivo processes can be monitored. Furthermore, to understand concentration-dependent responses, studies are traditionally repeated using different contaminant and toxin concentrations, which can make studies prohibitively long (potentially months). In this study, time-resolved non-uniform sampling NMR is performed in the presence of a contaminant concentration sweep. The result is that the lowest concentration that elicits a metabolic response can be rapidly detected, while the metabolic pathways impacted provide information about the toxic mode of action of the toxin. The lowest concentration of bisphenol A (BPA) that induces a response was ∼0.1 mg/L (detected in just 16 min), while changes in different metabolites suggest a complex multipathway response that leads to protein degradation at higher BPA concentrations. This proof of concept shows it is possible, on the basis of “real-time” organism responses, to identify the sublethal concentration at which a toxin impacts an organism and thus represents an essential analytical tool for the next generation of toxicity-based research and monitoring.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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