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Enregistrement W3036439734 · doi:10.1186/s12885-020-07038-2

Immune characterization of metastatic colorectal cancer patients post reovirus administration

2020· article· en· W3036439734 sur OpenAlexafffund
Ruwan Y. Parakrama, Elisha J. Fogel, Carol Chandy, Titto Augustine, Matt Coffey, Lydia Tesfa, Sanjay Goel, Radhashree Maitra

Notice bibliographique

RevueBMC Cancer · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensOncolytics Biotech (Canada)
Organismes subventionnairesInstitute of Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences and Peking Union Medical CollegeAlbert Einstein College of Medicine, Yeshiva UniversityNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthOncolytics BiotechYeshiva University
Mots-clésImmune systemMedicinePeripheral blood mononuclear cellImmunologyCD8AntibodyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background KRAS mutations are prevalent in 40–45% of patients with colorectal cancer (CRC) and targeting this gene has remained elusive. Viruses are well known immune sensitizing agents. The therapeutic efficacy of oncolytic reovirus in combination with chemotherapy is examined in a phase 1 study of metastatic CRC. This study evaluates the nature of immune response by determining the cytokine expression pattern in peripheral circulation along with the distribution of antigen presenting cells (APCs) and activated T lymphocytes. Further the study evaluates the alterations in exosomal and cellular microRNA levels along with the effect of reovirus on leukocyte transcriptome. Methods Reovirus was administered as a 60-min intravenous infusion for 5 consecutive days every 28 days, at a tissue culture infective dose (TCID 50 ) of 3 × 10 10 . Peripheral blood mononuclear cells (PBMC) were isolated from whole blood prior to reovirus administration and post-reovirus on days 2, 8, and 15. The expression profile of 25 cytokines in plasma was assessed (post PBMC isolation) on an EMD Millipore multiplex Luminex platform. Exosome and cellular levels of miR-29a-3p was determined in pre and post reovirus treated samples. Peripheral blood mononuclear cells were stained with fluorophore labelled antibodies against CD4, CD8, CD56, CD70, and CD123, fixed and evaluated by flow cytometry. The expression of granzyme B was determined on core biopsy of one patient. Finally, Clariom D Assay was used to determine the expression of 847 immune-related genes when compared to pre reovirus treatment by RNA sequencing analysis. A change was considered if the expression level either doubled or halved and the significance was determined at a p value of 0.001. Results Cytokine assay indicated upregulation at day 8 for IL-12p40 (2.95; p = 0.05); day 15 for GM-CSF (3.56; p = 0.009), IFN-y (1.86; p = 0.0004) and IL-12p70 (2.42; p = 0.02). An overall reduction in IL-8, VEGF and RANTES/CCL5 was observed over the 15-day period. Statistically significant reductions were observed at Day 15 for IL-8 (0.457-fold, 53.3% reduction; p = 0.03) and RANTES/CC5 (0.524-fold, 47.6% reduction; p = 0.003). An overall increase in IL-6 was observed, with statistical significance at day 8 (1.98- fold; 98% increase, p = 0.00007). APCs were stimulated within 48 h and activated (CD8 + CD70 + ) T cells within 168 h as determine by flow cytometry. Sustained reductions in exosomal and cellular levels of miR-29a-3p (a microRNA upregulated in CRC and associated with decreased expression of the tumor suppressor WWOX gene) was documented. Reovirus administration further resulted in increases in KRAS (33x) , IFNAR1 (20x), STAT3 (5x), and TAP1 (4x) genes after 2 days; FGCR2A (23x) and CD244 (3x) after 8 days; KLRD1 (14x), TAP1 (2x) and CD244 (2x) after 15 days. Reductions (> 0.5x) were observed in VEGFA (2x) after 2 days ; CXCR2 (2x), ITGAM (3x) after 15 days. Conclusions Reovirus has profound immunomodulatory properties that span the genomic, protein and immune cell distribution levels. This is the first study with reovirus in cancer patients that demonstrates these multi- layered effects, demonstrating how reovirus can function as an immune stimulant (augmenting the efficacy of immuno-chemo-therapeutic drugs), and an oncolytic agent. Reovirus thus functions bimodally as an oncolytic agent causing lysis of tumor cells, and facilitator of immune-mediated recognition and destruction of tumor cells. Graphical abstract

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,431

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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