MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3036481494 · doi:10.1107/s2059798320007603

Macromolecular crystallography beamlines at the Canadian Light Source: building on success

2020· article· en· W3036481494 sur OpenAlexafffundabout
Michel Fodje, K. Mundboth, Shaunivan Labiuk, Kathryn Janzen, James Gorin, Denis M. Spasyuk, S. Colville, Paweł Grochulski

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section D Structural Biology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueEnzyme Structure and Function
Établissements canadiensCanadian Light Source (Canada)
Organismes subventionnairesGovernment of SaskatchewanCanada Foundation for InnovationNational Research Council CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Saskatchewan
Mots-clésMonochromatorUpgradeUndulatorDetectorSoftwareOpticsFocus (optics)Materials scienceComputer scienceBeam (structure)PhysicsOperating system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Canadian Macromolecular Crystallography Facility (CMCF) consists of two beamlines dedicated to macromolecular crystallography: CMCF-ID and CMCF-BM. After the first experiments were conducted in 2006, the facility has seen a sharp increase in usage and has produced a significant amount of data for the Canadian crystallographic community. Upgrades aimed at increasing throughput and flux to support the next generation of more demanding experiments are currently under way or have recently been completed. At CMCF-BM, this includes an enhanced monochromator, automounter software upgrades and a much faster detector. CMCF-ID will receive a major upgrade including a new undulator, a new monochromator and new optics to stably focus the beam onto a smaller sample size, as well as a brand-new detector.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,958
Score d'incertitude au seuil0,343

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0040,006
Études des sciences et des technologies0,0080,002
Communication savante0,0050,003
Science ouverte0,0050,003
Intégrité de la recherche0,0020,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0290,013

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueActa Crystallographica Section D Structural BiologyMême sujetEnzyme Structure and FunctionTravaux en français237 207