Strengthening mycology research through coordinated access to microbial culture collection strains
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Well-managed genetic resources and associated metadata are essential to underpin research addressing the challenges to food security, healthcare, climate change, biodiversity, environment, education and our bio-based economy. Culture collections have supported microbiology research for over 100 years, whether they are collections belonging to individual scientists or institutional repositories. The 790 collections registered with the World Data Centre for Microorganisms (WDCM) together hold over three million strains representing a wide range of microbial diversity. This review provides an overview of the uses and outputs of collections that support work in mycology, agriculture and the environment. Further, it focusses on the advantages of coordinating efforts and establishes recommendations to improve resource provisions for research and the development of the necessary infrastructure. The CABI living resource collection provides an example that holds over 28,000 strains of fungi from 100 years of research in mycology. In the modern era, microbial interventions and solutions require knowledge not only of those microorganisms that can be grown and preserved axenically but also whole microbial communities: i.e. ‘microbiomes’. Current technologies enable us to access this latter, hidden resource, thereby facilitating a better understanding of how to harness and manipulate microbial communities to improve crop yields and allow successful interventions such as biocontrol of pests, diseases and invasive species. The WDCM Analyzer of Bio-resource Citations reports that 79,224 strains from 131 collections from 50 countries have been cited in 145,133 papers published in 50,307 journals from January, 1953 until April, 2020. These organisms have a multitude of uses, for example as sources of antibiotics, therapeutic drugs and other active agents. They have been applied widely including in the biodegradation, bioremediation, biotransformation and biotreatment of wastes. Further uses include interventions in agriculture for soil and plant health or biological control of pests and diseases. All of the above may be achieved by individual institutions but, by working together, collections can form a critical mass to focus on key global issues and can achieve much more. Mechanisms are suggested for coordinating collections in order to deliver a more comprehensive support system in the advancement of science and innovation.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle