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Enregistrement W3036539069 · doi:10.1101/2020.06.18.157818

Comparison of human and mouse fetal intestinal tissues reveals differential maturation timelines

2020· preprint· en· W3036539069 sur OpenAlexafffund
Apiradee Lim, Rohan R. Nadkarni, Brianna Courteau, Jonathan S. Draper

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDigestive system and related health
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of TorontoMcMaster University
Mots-clésBiologyIntestinal epitheliumHuman gastrointestinal tractGastrointestinal tractFetusCell biologyImmunologyEpitheliumPregnancyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Maturation of the intestinal epithelium is a necessary step for development of a fully functioning gastrointestinal tract. Studies of rodent gastrointestinal development and maturation have long been used to guide understanding of human intestinal maturation, in part because accessing human gestational stage intestinal tissues to perform equivalent human studies can be difficult. Notable differences have already been described in the timing of key stages in intestinal development between rodents and humans, but the conservation of intestinal maturation events between the two species is poorly understood. We hypothesized that species-related differences in intestinal development would alter the timing of key maturation events between human and mouse. We tested our hypothesis by performing a detailed comparison of hallmarks of intestinal maturation in human and mouse gestational intestine, including markers that describe the emergence of intestinal cell types, functionality and structural integrity. Our study demonstrates clear timing differences between maturation stages in mouse and human, with the majority of human maturation hallmarks acquired post-partum, in contrast to their gestational emergence in mouse. Our work suggests caution when translating murine intestinal maturation observations to the human, and provides a maturation road map that will be helpful to those seeking to produce mature intestine from in vitro stem cell sources.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,063
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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