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Enregistrement W3036553454 · doi:10.1101/2020.06.21.163436

Extracellular lipids of <i>Camelina sativa</i> : Characterization of cutin and suberin reveals typical polyester monomers and novel functionalized dicarboxylic fatty acids

2020· preprint· en· W3036553454 sur OpenAlexafffund
Fakhria M. Razeq, Dylan K. Kosma, Débora França, Owen Rowland, Isabel Molina

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Surface Properties and Treatments
Établissements canadiensAlgoma UniversityCarleton University
Organismes subventionnairesCiência sem FronteirasNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCollege of Engineering, Michigan State UniversityCanada Research ChairsMichigan State UniversityNational Science Foundation
Mots-clésCutinSuberinCamelinaCamelina sativaCuticle (hair)PolyesterFatty acidChemistryPlant cuticleMonomerWaxBotanyOrganic chemistryBiologyBiochemistryCell wallFood sciencePolymerCrop

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Camelina sativa is relatively drought tolerant and requires less fertilizer than other oilseed crops. Various lipid- and phenolic-based extracellular barriers of plants help to protect them against biotic and abiotic stresses. These barriers, which consist of solvent-insoluble polymeric frameworks and solvent-extractable waxes, include the cuticle of aerial plant surfaces and suberized cell walls found, for example, in periderms and seed coat. Cutin, the polymeric matrix of the cuticle, and the aliphatic domain of suberin are fatty acid- and glycerol-based polyesters. These polyesters were investigated by base-catalyzed transesterification of C. sativa aerial and underground delipidated tissues followed by gas chromatographic analysis of the released monomer mixtures. Seed coat and root suberin had similar compositions, with 18-hydroxyoctadecenoic and 1,18-octadecenedioic fatty acids being the dominant species. Root suberin presented a typical lamellar ultrastructure, but seed coats showed almost imperceptible, faint dark bands. Leaf and stem lipid polyesters were composed of fatty acids (FA), dicarboxylic acids (DCA), ω-hydroxy fatty acids (OHFA) and hydroxycinnamic acid derivatives (HCA). Dihydroxypalmitate (DHP) and caffeic acid were the major constituents of leaf cutin, whereas stem cutin presented similar molar proportions in several monomers across the four classes. Unlike the leaf cuticle, the C. sativa stem cuticle presented lamellar structure by transmission electron microscopy. Flower cutin was dominated by DHP and did not contain aromatics. We found striking differences between the lipid polyester monomer compositions of aerial tissues of C. sativa and that of its close relatives Arabidopsis thaliana and Brassica napus . Graphical Abstract Camelina sativa leaf and stem cutin is dominated by 16:0 dihydroxy fatty acid and aromatics, with dicarboxylic fatty acids representing 20-30 % of the monomers. Suberin of root and seed coat is largely composed of 18:1 dicarboxylic and ω-hydroxy fatty acids. Highlight bullet points Camelina sativa is an oil crop tolerant to biotic and abiotic stresses Extracellular lipid polyesters may in part confer these attributes Dihydroxypalmitate and caffeic acid were major components of C. sativa leaf cutin Flower cutin lacked aromatics and contained monomers not previously reported Root and seed coat suberin was dominated by 18:1 ω-hydroxy and dicarboxylic fatty acids C18 monounsaturated photo-oxidation products were found in leaf cutin and suberin

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,189
Écart entre enseignants0,168 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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