The genome of Prasinoderma coloniale unveils the existence of a third phylum within green plants
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Genome analysis of the pico-eukaryotic marine green algaPrasinoderma colonialeCCMP 1413 unveils the existence of a novel phylum within green plants (Viridiplantae), the Prasinodermophyta, which diverged before the split of Chlorophyta and Streptophyta. Structural features of the genome and gene family comparisons revealed an intermediate position of theP. colonialegenome (25.3 Mb) between the extremely compact, small genomes of picoplanktonic Mamiellophyceae (Chlorophyta) and the larger, more complex genomes of early-diverging streptophyte algae. Reconstruction of the minimal core genome of Viridiplantae allowed identification of an ancestral toolkit of transcription factors and flagellar proteins. Adaptations ofP. colonialeto its deep-water, oligotrophic environment involved expansion of light-harvesting proteins, reduction of early light-induced proteins, evolution of a distinct type of C4photosynthesis and carbon-concentrating mechanism, synthesis of the metal-complexing metabolite picolinic acid, and vitamin B1, B7and B12auxotrophy. TheP. colonialegenome provides first insights into the dawn of green plant evolution.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».