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Enregistrement W3036702906 · doi:10.1038/s41416-020-0900-0

Clinical and pathological associations of PTEN expression in ovarian cancer: a multicentre study from the Ovarian Tumour Tissue Analysis Consortium

2020· article· en· W3036702906 sur OpenAlexafffund
Filipe Correia Martins, Dominique‐Laurent Couturier, Anna Paterson, Anthony N. Karnezis, Christine Chow, Tayyebeh M. Nazeran, Adekunle Odunsi, Aleksandra Gentry‐Maharaj, Aleksandra Vrvilo, Alexander Hein, Aline Talhouk, Ana Osório, Andreas D. Hartkopf, Angela Brooks‐Wilson, Anna DeFazio, Anna Fischer, Arndt Hartmann, Brenda Y. Hernandez, Bryan M. McCauley, Chloe Karpinskyj, Christiani Bisinoto de Sousa, Claus Høgdall, Daniel Guimarães Tiezzi, Esther Herpel, Florin‐Andrei Taran, Francesmary Modugno, Gary L. Keeney, Gregg Nelson, Helen Steed, Honglin Song, Hugh Luk, Javier Benı́tez, Jennifer Alsop, Jennifer M. Koziak, Jenny Lester, Joseph H. Rothstein, Jurandyr Moreira de Andrade, Lene Lundvall, Luis Paz‐Ares, Luis A. Díaz‐Robles, Lynne R. Wilkens, María J. García, Maria P. Intermaggio, Marie‐Lyne Alcaraz, Mary Anne Brett, Matthias W. Beckmann, Mercedes Jimenez‐Liñan, Michael S. Anglesio, Michael E. Carney, Michael Schneider, Nadia Traficante, Nadja Pejovic, Naveena Singh, Nhu D. Le, Hans‐Peter Sinn, Prafull Ghatage, Ramona Erber, Robert P. Edwards, Robert A. Vierkant, Roberta B. Ness, Samuel Leung, Sandra Oršulić, Sara Y. Brucker, Scott H. Kaufmann, Sián Fereday, Simon A. Gayther, Stacey J. Winham, Stefan Kommoss, Tanja Pejović, Teri A. Longacre, Valerie McGuire, Valerie Rhenius, Weiva Sieh, Yurii B. Shvetsov, Alice S. Whittemore, Annette Staebler, Beth Y. Karlan, Cristina Rodríguez‐Antona, David D.L. Bowtell, Ellen L. Goode, Estrid Høgdall, Francisco José Cândido dos Reis, Jacek Gronwald, Jenny Chang‐Claude, Kirsten B. Moysich, Linda E. Kelemen, Linda S. Cook, Marc T. Goodman, Peter A. Fasching, Robin Crawford, Suha Deen, Usha Menon, David G. Huntsman, Martin Köbel, Susan J. Ramus, Paul D.P. Pharoah, James D. Brenton

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Cancer · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOvarian cancer diagnosis and treatment
Établissements canadiensBC Cancer AgencyAlberta Health ServicesRoyal Alexandra HospitalCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British ColumbiaVancouver General HospitalUniversity of CalgaryVancouver Coastal Health
Organismes subventionnairesMedical Research and Materiel CommandNational Cancer InstituteCancer Council TasmaniaNational Center for Advancing Translational SciencesMedical Research CouncilPeter MacCallum FoundationNational Center for Research ResourcesOak FoundationBC Cancer FoundationCanada Research ChairsConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoNational Institutes of HealthCancer Institute NSWNational Health and Medical Research CouncilAmerican Cancer SocietyAcademy of Medical SciencesCalgary Laboratory ServicesUniversity of CambridgeUniversity College LondonCancer Research UKMichael Smith Health Research BCDeutsches KrebsforschungszentrumCancer Council VictoriaCancer AustraliaKræftens BekæmpelseBundesministerium für Bildung und ForschungNational Institute for Health and Care ResearchOvarian Cancer Australia
Mots-clésOvarian cancerPTENPathologicalOncologyMedicinePathologyOvarian tissueOvaryCancerInternal medicineBiologyGeneticsPI3K/AKT/mTOR pathwayApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: PTEN loss is a putative driver in histotypes of ovarian cancer (high-grade serous (HGSOC), endometrioid (ENOC), clear cell (CCOC), mucinous (MOC), low-grade serous (LGSOC)). We aimed to characterise PTEN expression as a biomarker in epithelial ovarian cancer in a large population-based study. METHODS: Tumours from 5400 patients from a multicentre observational, prospective cohort study of the Ovarian Tumour Tissue Analysis Consortium were used to evaluate associations between immunohistochemical PTEN patterns and overall survival time, age, stage, grade, residual tumour, CD8+ tumour-infiltrating lymphocytes (TIL) counts, expression of oestrogen receptor (ER), progesterone receptor (PR) and androgen receptor (AR) by means of Cox proportional hazard models and generalised Cochran-Mantel-Haenszel tests. RESULTS: Downregulation of cytoplasmic PTEN expression was most frequent in ENOC (most frequently in younger patients; p value = 0.0001) and CCOC and was associated with longer overall survival in HGSOC (hazard ratio: 0.78, 95% CI: 0.65-0.94, p value = 0.022). PTEN expression was associated with ER, PR and AR expression (p values: 0.0008, 0.062 and 0.0002, respectively) in HGSOC and with lower CD8 counts in CCOC (p value < 0.0001). Heterogeneous expression of PTEN was more prevalent in advanced HGSOC (p value = 0.019) and associated with higher CD8 counts (p value = 0.0016). CONCLUSIONS: PTEN loss is a frequent driver in ovarian carcinoma associating distinctly with expression of hormonal receptors and CD8+ TIL counts in HGSOC and CCOC histotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations68
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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