Molecular analysis of mutated<i>Lactobacillus acidophilus</i>promoter-like sequence P15
Notice bibliographique
Résumé
The promoter-like sequence P15 that was previously cloned from the chromosome of Lactobacillus acidophilus ATCC 4356 is active in Lactobacillus reuteri, Lactobacillus plantarum, Lactobacillus acidophilus, and Escherichia coli, but not in Lactococcus lactis. N-methyl-N-nitroso-N-guanidine (MNNG) mutagenesis of P15 was used to select for a promoter active in L. lactis MG1363. Molecular analysis of the mutated promoter (designated P16) revealed a 90 bp deletion and a T[Formula: see text]A transversion. This deletion, in combination with the addition to the transversion, created a promoter with putative -35 and -10 hexamers identical to the consensus promoter sequence found in E. coli and Bacillus subtilis vegetative promoters. The activity of P16 was measured by its ability to promote chloramphenicol resistance in different bacteria when inserted in the promoter-probe plasmid pBV5030 (designated pLA16). The MIC of chloramphenicol in L. lactis, L. reuteri, L. plantarum, E. coli, and L. acidophilus harbouring pLA16 were 30, 170, 180, >500, and 3 µg/mL, respectively. This represents an increase in promoter activity compared to P15 in L. reuteri of 3-fold, in L. plantarum of 9-fold, and in E. coli of at least 2.5-fold, but a decrease in L. acidophilus of 7-fold.Key words: Lactobacillus acidophilus, promoter-like sequence, mutagenesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».