Selection of established tumour cells through narrow diameter micropores enriches for elevated Ras/Raf/MEK/ERK MAPK signalling and enhanced tumour growth
Notice bibliographique
Résumé
As normal cells become cancer cells, and progress towards malignancy, they become progressively softer. Advantages of this change are that tumour cells become more deformable, and better able to move through narrow constraints. We designed a positive selection strategy that enriched for cells which could move through narrow diameter micropores to identify cell phenotypes that enabled constrained migration. Using human MDA MB 231 breast cancer and MDA MB 435 melanoma cancer cells, we found that micropore selection favoured cells with relatively higher Ras/Raf/MEK/ERK mitogen-activated protein kinase (MAPK) signalling, which affected actin cytoskeleton organization, focal adhesion density and cell elasticity. In this follow-up study, we provide further evidence that selection through micropores enriched for cells with altered cell morphology and adhesion. Additional analysis of RNA sequencing data revealed a set of transcripts associated with small cell size that was independent of constrained migration. Gene set enrichment analysis identified the ‘matrisome’ as the most significantly altered gene set linked with small size. When grown as orthotopic xenograft tumours in immunocompromised mice, micropore selected cells grew significantly faster than Parent or Flow-Sorted cells. Using mathematical modelling, we determined that there is an interaction between 1) the cell to gap size ratio; 2) the bending rigidity of the cell, which enable movement through narrow gaps. These results extend our previous conclusion that Ras/Raf/MEK/ERK MAPK signalling has a significant role in regulating cell biomechanics by showing that the selective pressure of movement through narrow gaps also enriches for increased tumour growth in vivo.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».